Russian Journal of Biological Physics and Chemisrty Russian Journal of Biological Physics and Chemisrty АКТУАЛЬНЫЕ ВОПРОСЫ БИОЛОГИЧЕСКОЙ ФИЗИКИ И ХИМИИ 2499-9962 54025 МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОФИЗИКА И ФИЗИКА БИОМОЛЕКУЛ MOLECULAR BIOPHYSICS AND PHYSICS OF BIOMOLECULES МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОФИЗИКА И ФИЗИКА БИОМОЛЕКУЛ STATISTICAL ANALYSIS OF EXPERIMENTAL VALUES OF PROTONS CHEMICAL SHIFTS OLIGONUCLEOTIDES OF VARIOUS CONTENT AND BASE SEQUENCE IN THE NUCLEOTIDE CHAIN СТАТИСТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫХ ЗНАЧЕНИЙ ХИМИЧЕСКИХ СДВИГОВ ПРОТОНОВ ДЕЗОКСИОЛИГОНУКЛЕОТИДОВ РАЗЛИЧНОГО СОСТАВА И ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТИ ОСНОВАНИЙ В ЦЕПИ Завьялова О С Zavyalova O S zavyalova.os@yandex.ru Рогова О В Rogova O V ФГАОУ ВО «Севастопольский государственный университет» ru Sevastopol State University ru ФГАОУ ВО «Севастопольский государственный университет» ru Sevastopol State University ru 25 06 2016 25 06 2016 1 1 187 191 20 06 2016 20 06 2016 https://rusjbpc.ru/en/nauka/article/54025/view

Методом главных компонент проведен анализ экспериментальных значений химических сдвигов необменивающихся протонов само- и несамокомплементарных дезоксиолигонуклеотидов различного состава и последовательности оснований в цепи. Выявлены признаки, наиболее существенно влияющие на магнитное экранирование протонов оснований рассмотренных коротких фрагментов ДНК.

The analysis of experimental values of chemical shifts of non-exchanging protons of deoxyoligonucleotides of various content and base sequence in the nucleotide chain has been made using the method of Principal Components Analysis. Most important factors influencing the shielding of protons of the considered short fragments of DNA are revealed.

 дезоксиолигонуклеотид химический сдвиг триплет главные компоненты deoxyoligonucleotide chemical shift triplet the principal components

Веселков А.Н., Дэвис Д., Дымант Л.Н., Паркес Х. 1М- и 2М- 1Н-ЯМР исследование самоассоциации дезокситетрануклеозидтрифосфатов различной последовательности оснований в водном растворе. Биополимеры и клетка, 1991, т. 7, № 5, с. 15-22. [Veselkov A.N., Daviеs D., Djimant L. N., Parkes H. 1D- and 2D- 1H NMR investigation of self-association of deoxytetranucleotides of different base sequence in aqueous solution. Biopolymers and Cell, 1991, vol. 7, no. 5, рр. 15-22. (In Russ.)] Veselkov A.N., Devis D., Dymant L.N., Parkes H. 1M- i 2M- 1N-YaMR issledovanie samoassociacii dezoksitetranukleozidtrifosfatov razlichnoy posledovatel'nosti osnovaniy v vodnom rastvore. Biopolimery i kletka, 1991, t. 7, № 5, s. 15-22. [Veselkov A.N., Davies D., Djimant L. N., Parkes H. 1D- and 2D- 1H NMR investigation of self-association of deoxytetranucleotides of different base sequence in aqueous solution. Biopolymers and Cell, 1991, vol. 7, no. 5, rr. 15-22. (In Russ.)] Веселков А.Н., Пахомов В.И., Итон Р., Дэвис Д. ЯМР-исследование самоассоциации молекул дезоксигексануклеотидов 5¢-d(CpGpTpApCpG) и 5¢-d(CpGpCpGpCpG) в водном растворе. Биофизика, 2000, т. 45, с. 20-26. [Veselkov A.N., Pahomov V.I., Eaton R., Daviеs D. NMR investigation of self-association of hexadeoxynucleotides 5¢-d(CpGpTpApCpG) and 5¢-d(CpGpCpGpCpG) in aqueous solution. Biophysics, 2000, vol. 45, рр. 20-26. (In Russ.)] Veselkov A.N., Pahomov V.I., Iton R., Devis D. YaMR-issledovanie samoassociacii molekul dezoksigeksanukleotidov 5¢-d(CpGpTpApCpG) i 5¢-d(CpGpCpGpCpG) v vodnom rastvore. Biofizika, 2000, t. 45, s. 20-26. [Veselkov A.N., Pahomov V.I., Eaton R., Davies D. NMR investigation of self-association of hexadeoxynucleotides 5¢-d(CpGpTpApCpG) and 5¢-d(CpGpCpGpCpG) in aqueous solution. Biophysics, 2000, vol. 45, rr. 20-26. (In Russ.)] Daviеs B.D., Pahomov V.I., Veselkov A.N. NMR determination of the conformation and drug binding properties of the DNA heptamer d(GpCpGpАpАpGpC) in aqueous solution. Nucleic Acids Res., 1997, vol. 25, pр. 4523-4531. Davies B.D., Pahomov V.I., Veselkov A.N. NMR determination of the conformation and drug binding properties of the DNA heptamer d(GpCpGpApApGpC) in aqueous solution. Nucleic Acids Res., 1997, vol. 25, pr. 4523-4531. Altona C, Faber D.H., Westra Hoekzema A.J.A. Double-helical DNA 1H chemical shifts: an accurate and balanced predictive empirical scheme. Magn. Reson. Chem., 2000, vol.38, pр.95-107. Altona C, Faber D.H., Westra Hoekzema A.J.A. Double-helical DNA 1H chemical shifts: an accurate and balanced predictive empirical scheme. Magn. Reson. Chem., 2000, vol.38, pr.95-107. Эсбенсен К. Анализ многомерных данных, сокр. пер. с англ. под ред. О. Родионовой, Изд-во ИПХФ РАН, 2005, 204с. [Esbensen K.H. Multivariate Data Analysis, abbr. per. from English. ed. О. Rodionova, ICP RAS, 2005, 204 p. (In Russ.)] Esbensen K. Analiz mnogomernyh dannyh, sokr. per. s angl. pod red. O. Rodionovoy, Izd-vo IPHF RAN, 2005, 204s. [Esbensen K.H. Multivariate Data Analysis, abbr. per. from English. ed. O. Rodionova, ICP RAS, 2005, 204 p. (In Russ.)]