Russian Journal of Biological Physics and Chemisrty Russian Journal of Biological Physics and Chemisrty АКТУАЛЬНЫЕ ВОПРОСЫ БИОЛОГИЧЕСКОЙ ФИЗИКИ И ХИМИИ 2499-9962 54242 Общая биофизика General biophysics Общая биофизика STRUCTURAL STUDIES OF N-TERMINAL DIMERIZATION DOMAIN OF CLAMP PROTEIN USING SMALL-ANGLE X-RAY SCATTERING (SAXS) ИССЛЕДОВАНИЕ СТРУКТУРЫ N-КОНЦЕВОГО ДИМЕРИЗУЮЩЕГО ДОМЕНА БЕЛКА CLAMP МЕТОДОМ МАЛОУГЛОВОГО РАССЕЯНИЯ РЕНТГЕНОВСКИХ ЛУЧЕЙ (SAXS) Тихонова Е А Tikhonova E A errinaceus@rambler.ru Бончук А Н Bonchuk A N Качалова Г С Kachalova G S Георгиев П Г Georgiev P G Максименко О Г Maksimenko O G Институт биологии гена РАН ru Institute of gene biology RAS ru Институт биологии гена РАН ru Institute of gene biology RAS ru ФИЦ Биотехнологии РАН ru Research Center of Biotechnology RAS ru Институт биологии гена РАН ru Institute of gene biology RAS ru Институт биологии гена РАН ru Institute of gene biology RAS ru 25 03 2018 25 03 2018 3 1 43 45 20 03 2018 20 03 2018 https://rusjbpc.ru/en/nauka/article/54242/view

CLAMP - транскрипционный фактор Drosophila, участвующий в привлечении комплекса дозовой компенсации на специфические сайты ДНК. При помощи малоуглового рассеяния рентгеновских лучей (SAXS) получены данные о пространственной структуре N-концевого домена данного белка, содержащего домен типа «цинковый палец» и прилежащую аминокислотную последовательность с неизвестной структурой. Для этого домена ранее была показана способность к гомо-димеризации и взаимодействию с комплексом дозовой компенсации. Домен типа «цинковый палец» важен для функциональной активности N-концевого домена. Данные SAXS подтверждают, что N-концевой домен CLAMP является димером, свернут и имеет компактную симметричную структуру.

CLAMP is Drosophila transcription factor involved in the recruitment of Dosage Compensation Complex. Spatial structure of N-terminal domain of CLAMP protein from Drosophila was studied using small-angle X-ray scattering (SAXS). This domain contains zinc-finger and adjacent amino-acid sequence with unknown structure. Earlier dimerization activity and binding of dosage compensation complex were shown for this domain. SAXS data confirm dimer formation and provide insight into the structure of the domain, which is folded, and have compact symmetrical structure.

 мультимеризация малоугловое рассеяние рентгеновских лучей хроматин multimerization small-angle X-ray scattering chromatin

Kuroda M.I., Hilfiker A., Lucchesi J.C. Dosage Compensation in Drosophila-a Model for the Coordinate Regulation of Transcription. Genetics, 2016, vol. 204, pp. 435-450. Kuroda M.I., Hilfiker A., Lucchesi J.C. Dosage Compensation in Drosophila-a Model for the Coordinate Regulation of Transcription. Genetics, 2016, vol. 204, pp. 435-450. Hallacli E., Lipp M., Georgiev P., Spielman C., Cusack S., Akhtar A., Kadlec J. Msl1-mediated dimerization of the dosage compensation complex is essential for male X-chromosome regulation in Drosophila. Mol Cell, 2012, vol. 48, pp.587-600. Hallacli E., Lipp M., Georgiev P., Spielman C., Cusack S., Akhtar A., Kadlec J. Msl1-mediated dimerization of the dosage compensation complex is essential for male X-chromosome regulation in Drosophila. Mol Cell, 2012, vol. 48, pp.587-600. Kadlec J., Hallacli E., Lipp M., Holz H., Sanchez-Weatherby J., Cusack S., Akhtar A. Structural basis for MOF and MSL3 recruitment into the dosage compensation complex by MSL1. Nat. Struct. Mol. Biol., 2011, vol. 18, pp. 142-149. Kadlec J., Hallacli E., Lipp M., Holz H., Sanchez-Weatherby J., Cusack S., Akhtar A. Structural basis for MOF and MSL3 recruitment into the dosage compensation complex by MSL1. Nat. Struct. Mol. Biol., 2011, vol. 18, pp. 142-149. Alekseyenko A.A., Ho J.W., Peng S., Gelbart M., Tolstorukov M.Y., Plachetka A., Kharchenko P.V., Jung Y.L., Gorchakov A.A., Larschan E. Sequence-specific targeting of dosage compensation in Drosophila favors an active chromatin context. PLoS Genet., 2012, vol. 8, e1002646. Alekseyenko A.A., Ho J.W., Peng S., Gelbart M., Tolstorukov M.Y., Plachetka A., Kharchenko P.V., Jung Y.L., Gorchakov A.A., Larschan E. Sequence-specific targeting of dosage compensation in Drosophila favors an active chromatin context. PLoS Genet., 2012, vol. 8, e1002646. Straub T., Zabel A., Gilfillan G.D., Feller C., Becker P.B. Different chromatin interfaces of the Drosophila dosage compensation complex revealed by high-shear ChIP-seq. Genome Res., 2013, vol. 23, pp. 473-485. Straub T., Zabel A., Gilfillan G.D., Feller C., Becker P.B. Different chromatin interfaces of the Drosophila dosage compensation complex revealed by high-shear ChIP-seq. Genome Res., 2013, vol. 23, pp. 473-485. Straub T., Grimaud C., Gilfillan G.D., Mitterweger A., Becker P.B. The chromosomal high-affinity binding sites for the Drosophila dosage compensation complex. PLoS Genet, 2008, e1000302. Straub T., Grimaud C., Gilfillan G.D., Mitterweger A., Becker P.B. The chromosomal high-affinity binding sites for the Drosophila dosage compensation complex. PLoS Genet, 2008, e1000302. Larschan E., Soruco M.M., Lee O.K., Peng S., Bishop E., Chery J., Goebel K., Feng J., Park P.J., Kuroda M.I. Identification of chromatin-associated regulators of MSL complex targeting in Drosophila dosage compensation. PLoS Genet., 2012, vol. 8, e1002830. Larschan E., Soruco M.M., Lee O.K., Peng S., Bishop E., Chery J., Goebel K., Feng J., Park P.J., Kuroda M.I. Identification of chromatin-associated regulators of MSL complex targeting in Drosophila dosage compensation. PLoS Genet., 2012, vol. 8, e1002830. Marcela М.I., Chery J., Bishop E.P., Siggers T., Tolstorukov M.Y., Leydon A.R., Sugden A.U., Goebel K., Feng J., Xia P., Vedenko.A, Bulyk М.I., Park P.J. and Larschan E. The CLAMP protein links the MSL complex to the X chromosome during Drosophila dosage compensation. Genes & development, 2013, vol. 27, pp. 1551-1556. Marcela M.I., Chery J., Bishop E.P., Siggers T., Tolstorukov M.Y., Leydon A.R., Sugden A.U., Goebel K., Feng J., Xia P., Vedenko.A, Bulyk M.I., Park P.J. and Larschan E. The CLAMP protein links the MSL complex to the X chromosome during Drosophila dosage compensation. Genes & development, 2013, vol. 27, pp. 1551-1556.