Russian Journal of Biological Physics and Chemisrty Russian Journal of Biological Physics and Chemisrty АКТУАЛЬНЫЕ ВОПРОСЫ БИОЛОГИЧЕСКОЙ ФИЗИКИ И ХИМИИ 2499-9962 54245 Общая биофизика General biophysics Общая биофизика STUDIES OF OCTAMERIC TRAMTRACK GROUP BTB-DOMAINS USING SMALL-ANGLE X-RAY SCATTERING (SAXS) ИССЛЕДОВАНИЕ ОКТАМЕРИЗУЮЩИХСЯ ВТВ-ДОМЕНОВ ГРУППЫ TRAMTRACK МЕТОДОМ МАЛОУГЛОВОГО РАССЕЯНИЯ РЕНТГЕНОВСКИХ ЛУЧЕЙ (SAXS) Бончук А Н Bonchuk A N errinaceus@rambler.ru Бойко К М Boyko K M Качалова Г С Kachalova G S Георгиев П Г Georgiev P G errinaceus@rambler.ru Максименко О Г Maksimenko O G errinaceus@rambler.ru Институт биологии гена РАН ru Institute of gene biology RAS ru ФИЦ Биотехнологии РАН; Национальный исследовательский центр «Курчатовский институт» ru Research Center of Biotechnology RAS; National Research Center “Kurchatov Institute” ru ФИЦ Биотехнологии РАН ru Research Center of Biotechnology RAS ru Институт биологии гена РАН ru Institute of gene biology RAS ru Институт биологии гена РАН ru Institute of gene biology RAS ru 25 03 2018 25 03 2018 3 1 60 62 20 03 2018 20 03 2018 https://rusjbpc.ru/en/nauka/article/54245/view

В геноме Drosophila присутствует несколько десятков транскрипционных факторов, содержащих ВТВ-домены, формирующие октамеры (группа ТТК). При помощи метода малоуглового рассеяния рентгеновских лучей (SAXS) получены первые данные о пространственной структуре доменов данного типа двух белков - CG6765 и CG32121. Данные SAXS подтверждают способность доменов этого типа к октамеризации. Построены модели низкого разрешения, позволяющие сделать выводы о пространственной организации октамеров.

Drosophila genome contains near 30 transcription factors containing BTB-domains able to form octamers (TTK group). Spatial structure of two domains of this group - CG6765 and CG32121 was studied using small-angle X-ray scattering (SAXS). SAXS data confirm that these domains are able to form octamers and provide insight into the structure of such octamers.

 мультимеризация малоугловое рассеяние рентгеновских лучей хроматин multimerization small-angle X-ray scattering chromatin

Stogios P.J., Downs G.S., Jauhal J.J., Nandra S.K., Prive G.G. Sequence and structural analysis of BTB domain proteins. Genome Biol., 2005, vol. 6, no. 10, p. R82, epub. Stogios P.J., Downs G.S., Jauhal J.J., Nandra S.K., Prive G.G. Sequence and structural analysis of BTB domain proteins. Genome Biol., 2005, vol. 6, no. 10, p. R82, epub. Bonchuk A., Denisov S., Georgiev P., Maksimenko O. Drosophila BTB/POZ domains of "ttk group" can form multimers and selectively interact with each other. J Mol Biol., 2011, vol. 412, pp. 423-436. Bonchuk A., Denisov S., Georgiev P., Maksimenko O. Drosophila BTB/POZ domains of "ttk group" can form multimers and selectively interact with each other. J Mol Biol., 2011, vol. 412, pp. 423-436. Ahmad K.F., Engel C.K., Prive G.G. Crystal structure of the BTB domain from PLZF. Proc Natl Acad Sci USA, 1998, vol. 95, pp. 12123-12128. Ahmad K.F., Engel C.K., Prive G.G. Crystal structure of the BTB domain from PLZF. Proc Natl Acad Sci USA, 1998, vol. 95, pp. 12123-12128. Ahmad K.F., Melnick A., Lax S., Bouchard D., Liu J., [et al.] Mechanism of SMRT corepressor recruitment by the BCL6 BTB domain. Mol Cell, 2003, vol. 12, pp. 1551-1564. Ahmad K.F., Melnick A., Lax S., Bouchard D., Liu J., [et al.] Mechanism of SMRT corepressor recruitment by the BCL6 BTB domain. Mol Cell, 2003, vol. 12, pp. 1551-1564. Stead M.A., Trinh C.H., Garnett J.A., Carr S.B., Baron A.J., [et al.] A beta-sheet interaction interface directs the tetramerisation of the Miz-1 POZ domain. J Mol Biol., 2007, vol. 373, pp. 820-826. Stead M.A., Trinh C.H., Garnett J.A., Carr S.B., Baron A.J., [et al.] A beta-sheet interaction interface directs the tetramerisation of the Miz-1 POZ domain. J Mol Biol., 2007, vol. 373, pp. 820-826. Zollman S., Godt D., Prive G.G., Couderc J.L., Laski F.A. The BTB domain, found primarily in zinc finger proteins, defines an evolutionarily conserved family that includes several developmentally regulated genes in Drosophila. Proc Natl Acad Sci USA, 1994, vol. 91, pp. 10717-10721. Zollman S., Godt D., Prive G.G., Couderc J.L., Laski F.A. The BTB domain, found primarily in zinc finger proteins, defines an evolutionarily conserved family that includes several developmentally regulated genes in Drosophila. Proc Natl Acad Sci USA, 1994, vol. 91, pp. 10717-10721.