Russian Journal of Biological Physics and Chemisrty Russian Journal of Biological Physics and Chemisrty АКТУАЛЬНЫЕ ВОПРОСЫ БИОЛОГИЧЕСКОЙ ФИЗИКИ И ХИМИИ 2499-9962 54460 Общая биофизика General biophysics Общая биофизика ON THE FEATURES OF CHIRAL SECONDARY STRUCTURES DETERMINING THE FUNCTIONS OF PROTEINS ОБ ОСОБЕННОСТЯХ ХИРАЛЬНЫХ ВТОРИЧНЫХ СТРУКТУР, ОПРЕДЕЛЯЮЩИХ ФУНКЦИИ БЕЛКОВ Багрова О Е Bagrova O E o-bagrova@mail.ru Малышко Е В Malyshko E V Твердислов В А Tverdislov V A Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова ru Lomonosov Moscow State University ru Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова ru Lomonosov Moscow State University ru Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова ru Lomonosov Moscow State University ru 25 12 2019 25 12 2019 4 4 447 451 20 12 2019 20 12 2019 https://rusjbpc.ru/en/nauka/article/54460/view

Современные методы исследований позволяют изучить структуру биополимера, но они не раскрывают полностью механизмы структурообразования. Изучение этих механизмов представляет особый интерес для биофизики. Впервые получено распределение вторичных структур с учётом знака хиральности по полипептидной цепи белков из 4 функциональных классов: вирусные белки, изомеразы, шапероны, оксидоредуктазы. Выявлены общие для всех исследуемых классов закономерности, а также отдельные для каждого класса особенности строения. Произведена компьютерная обработка каждого отдельного белка, по результатам которой построены диаграммы распределения вторичных структур по отдельной цепи и произведено усреднение для функционального класса.

Modern research methods allow us to study the structure of the biopolymer, but the mechanisms of structure formation are not clear for us. The study of these mechanisms is particular interest for Biophysics. In this paper, the distribution of secondary structures was considered taking into account the sign of chirality of the polypeptide chain of proteins from 4 functional classes: viral proteins, isomerases, chaperones, oxidoreductases. Common patterns for all classes and individual features of the structure for each class were found. Then computer processing of each protein was carried out. The distribution diagrams of each individual chain were constructed on the basis of the obtained results. As a result, several general patterns were revealed.

 хиральность белки вторичная структура -спираль β-лист chirality proteins secondary structure -helix β-sheet

Chou P.Y., Fasman G.D. Prediction of the secondary structure of proteins from their amino acid sequence. Adv. Enzymol Relat. Areas Mol. Biol., 1978, vol. 47, pp. 45-148. Chou P.Y., Fasman G.D. Prediction of the secondary structure of proteins from their amino acid sequence. Adv. Enzymol Relat. Areas Mol. Biol., 1978, vol. 47, pp. 45-148. Adzhubei A.A., Eisenmenge F.R., Tumanyan V.G., Zinke M., Brodzinski S., Esipova N.G. Journal of Biomolecular Structure & Dynamics, 1987, vol. 5, iss. 3. Adzhubei A.A., Eisenmenge F.R., Tumanyan V.G., Zinke M., Brodzinski S., Esipova N.G. Journal of Biomolecular Structure & Dynamics, 1987, vol. 5, iss. 3. Финкельштейн А.В., Птицын О.Б. Физика белка: курс лекций с цветными и стереоскопическими иллюстрациями и задачами. М: КДУ, 2012, 491 с. @@[Finkelstein A.V., Ptitsyn O. B. Protein physics: a course of lectures with color and stereoscopic illustrations and tasks. M: KDU, 2012, 491 p. (In Russ.)] Finkel'shteyn A.V., Pticyn O.B. Fizika belka: kurs lekciy s cvetnymi i stereoskopicheskimi illyustraciyami i zadachami. M: KDU, 2012, 491 s. @@[Finkelstein A.V., Ptitsyn O. B. Protein physics: a course of lectures with color and stereoscopic illustrations and tasks. M: KDU, 2012, 491 p. (In Russ.)] Тейлор Д., Грин Н., Стаут У. Биология: в 3 т. Т 1. М.: Лаборатория знаний, 2018, 454 с. @@[Taylor D., Green N., Stout W. Biology: in 3 vol. Vol. 1. M.: Laboratory of knowledge, 2018, 454 p. (In Russ.)] Teylor D., Grin N., Staut U. Biologiya: v 3 t. T 1. M.: Laboratoriya znaniy, 2018, 454 s. @@[Taylor D., Green N., Stout W. Biology: in 3 vol. Vol. 1. M.: Laboratory of knowledge, 2018, 454 p. (In Russ.)] Солдатенков А.Т. Основы органической химии лекарственных веществ. М.: Химия, 2001, 192 с. @@[Soldatenkov A. T. Fundamentals of organic chemistry of drugs. M.: Chemistry, 2001, 192 p. (In Russ.)] Soldatenkov A.T. Osnovy organicheskoy himii lekarstvennyh veschestv. M.: Himiya, 2001, 192 s. @@[Soldatenkov A. T. Fundamentals of organic chemistry of drugs. M.: Chemistry, 2001, 192 p. (In Russ.)] Твердислов В.А., Малышко Е.В., Ильченко С.А., Жулябина О.А., Яковенко Л.В. Периодическая система хиральных структур в молекулярной биологии. Биофизика, 2017, т. 62, вып. 3, с. 421-434. @@[Tverdislov V.A., Malyshko E.V., Ilchenko S.A., Zhulebino O.A., Yakovenko L.V. The periodic system of chiral structures in molecular biology. Biophysics, 2017, vol. 62, iss 3, pp. 421-434. (In Russ.)] Tverdislov V.A., Malyshko E.V., Il'chenko S.A., Zhulyabina O.A., Yakovenko L.V. Periodicheskaya sistema hiral'nyh struktur v molekulyarnoy biologii. Biofizika, 2017, t. 62, vyp. 3, s. 421-434. @@[Tverdislov V.A., Malyshko E.V., Ilchenko S.A., Zhulebino O.A., Yakovenko L.V. The periodic system of chiral structures in molecular biology. Biophysics, 2017, vol. 62, iss 3, pp. 421-434. (In Russ.)] Твердислов В.А., Сидорова А.Э., Яковенко Л.В. От симметрий - к законам эволюции. 1. Хиральность как инструмент стратификации активных сред. Биофизика, 2012, т. 57, вып. 1, с. 146-154. @@[Tverdislov V.A., Sidorova A.E., Yakovenko L.V. From symmetries to the laws of evolution.1. Chirality as an instrument of stratification of the active medium. Biofizika, 2012, vol. 57, no. 1, pp.146-154. (In Russ.)] Tverdislov V.A., Sidorova A.E., Yakovenko L.V. Ot simmetriy - k zakonam evolyucii. 1. Hiral'nost' kak instrument stratifikacii aktivnyh sred. Biofizika, 2012, t. 57, vyp. 1, s. 146-154. @@[Tverdislov V.A., Sidorova A.E., Yakovenko L.V. From symmetries to the laws of evolution.1. Chirality as an instrument of stratification of the active medium. Biofizika, 2012, vol. 57, no. 1, pp.146-154. (In Russ.)]