Russian Journal of Biological Physics and Chemisrty Russian Journal of Biological Physics and Chemisrty АКТУАЛЬНЫЕ ВОПРОСЫ БИОЛОГИЧЕСКОЙ ФИЗИКИ И ХИМИИ 2499-9962 54553 МЕДИЦИНСКАЯ БИОФИЗИКА И БИОФИЗИЧЕСКАЯ ХИМИЯ MEDICAL BIOPHYSICS AND BIOPHYSICAL CHEMISTRY МЕДИЦИНСКАЯ БИОФИЗИКА И БИОФИЗИЧЕСКАЯ ХИМИЯ Chromato-mass-spectrometric study of skin slime peptides of fish without scales Хромато-масс-спектрометрическое исследование пептидов кожного секрета безчешуйчатого вида рыб Меркулова Н Л Merkulova N L Грехнева Е В Grekhnyova E V grekhnyovaev@yandex.ru Чуйкова С В Chuikova S V Малышев В Н Malyshev V N Курский государственный университет ru Kursk State University ru Курский государственный университет ru Kursk State University ru ООО «Акватехнологии» ru Limited Liability Company «Aquatetechnologies» ru ООО «Акватехнологии» ru Limited Liability Company «Aquatetechnologies» ru 25 09 2020 25 09 2020 5 3 461 466 20 09 2020 20 09 2020 https://rusjbpc.ru/en/nauka/article/54553/view

В данной работе осуществлено выделение и анализ пептидной фракции секреторной жидкости клария угревидного (Clarias gariepinus). Выделение осуществлялось методами переосаждения и сопровождалось промежуточными очистками на сорбентах. Пептидная природа выделенной фракции подтверждалась методом ИК-спектроскопии. Масс-спектрометрический анализ пептидной фракции экстракта секреторной жидкости показал, что в составе преобладают хорошо удерживаемые пептиды с молекулярной массой 2000-3000 Да, а также более короткие гидрофильные пептиды. Последовательности пептидов определяли с помощью программного обеспечения Proteome Discoverer 1.4. (Thermo Scientific) с использованием базы данных аминокислотных последовательностей UniProt (uniprot-catfish+AND+organism__Clarias+gariepinus+ [13013]). Программно было найдено 14547 пепидных последовательностей, относящимся к 131 группе белков. Показано, что экстракт секреторной жидкости содержит большое количество пептидов, относящихся к различным классам белков протеома Clarias gariepinus (бета-актины, семейство цитохрома, белки теплового шока, миостатин, НАДН-дегидрогеназный комплекс и др.), которые определяют широкий набор биологических свойств, характерных для кожного секрета рыбы. Дальнейшее изучение кожного секрета клария угревидного представляется перспективным в плане фракционирования пептидного пула и определения фармакологической активности более узких фракций.

. In this work, the isolation and analysis of the peptide fraction of the secretory fluid of Clarias gariepinus was carried out. Isolation was carried out by reprecipitation methods and was accompanied by intermediate purifications on sorbents. The peptide nature of the isolated fraction was confirmed by IR spectroscopy. Mass spectrometric analysis of the peptide fraction of the secretory fluid extract showed that well-retained peptides with a molecular weight of 2000-3000 Da, as well as shorter hydrophilic peptides predominate in the composition. Peptide sequences were determined using Proteome Discoverer 1.4 software (Thermo Scientific) using the UniProt amino acid sequence database (uniprot-catfish + AND + organism__Clarias + gariepinus + [13013]). 14547 peptide sequences belonging to 131 protein groups were found programmatically. It was shown that secretory fluid extract contains a large number of peptides belonging to various classes of Clarias gariepinus proteome proteins (beta-actins, cytochrome family, heat shock proteins, myostatin, NADH-dehydrogenase complex, etc.), which determine a wide range of biological properties characteristic for skin secretion of fish. Further study of the skin secretion of clarius seems promising in terms of fractionation of the peptide pool and determination of the pharmacological activity of a narrower fraction.

 кларий угревидный кожный секрет пептидные фракции масс-спектрометрия секвенирование Clarias gariepinus skin secretion peptide fractions mass spectrometry sequencing

Артеменко К.А., Самгина Т.Ю., Дойл Дж Р., Льюеллин Л.Е., Билусич Д., Бови Дж Х., Лебедев А.Т. Защитные пептиды, выделенные из кожного секрета европейской озерной лягушки Rana ridibunda. Масс-спектрометрия, 2007, т. 4 (2), с. 79-88. Artemenko K.A., Samgina T.Yu., Doyl Dzh R., L'yuellin L.E., Bilusich D., Bovi Dzh H., Lebedev A.T. Zaschitnye peptidy, vydelennye iz kozhnogo sekreta evropeyskoy ozernoy lyagushki Rana ridibunda. Mass-spektrometriya, 2007, t. 4 (2), s. 79-88. Xiao Mei Wang, Wei Dai, Ke Zhing Xing,Tian Jun Li, Xin Wang Antibacterial activities of antibacterial proteins/peptides isolated from organs and mucus of Clarias gariepunus reared at high stocking density. Advanced Materials Research, 2012, pp. 455-460. Xiao Mei Wang, Wei Dai, Ke Zhing Xing,Tian Jun Li, Xin Wang Antibacterial activities of antibacterial proteins/peptides isolated from organs and mucus of Clarias gariepunus reared at high stocking density. Advanced Materials Research, 2012, pp. 455-460. Chen Cheng-xun Research on the isolation and purification of antimicrobial peptide in the surface mucus of catfish body and its antimicrobial activity. J. of Anhui Agricultural Sciences, vol. 26, 2010. Chen Cheng-xun Research on the isolation and purification of antimicrobial peptide in the surface mucus of catfish body and its antimicrobial activity. J. of Anhui Agricultural Sciences, vol. 26, 2010. Tingtin Li, Quanwei Liu, Dangfeng Wang, Jianrong Li Characterization and antimicrobial mechanism of CF-14, a new antimicrobial peptide from the epidermal mucus of catfish. Fish and shellfish immunology, vol. 92, 2019, pp. 881-888. Tingtin Li, Quanwei Liu, Dangfeng Wang, Jianrong Li Characterization and antimicrobial mechanism of CF-14, a new antimicrobial peptide from the epidermal mucus of catfish. Fish and shellfish immunology, vol. 92, 2019, pp. 881-888. Фомина Л.Л., Кулакова Т.С., Жунина О.А., Ошуркова Ю.Л., Вайцель А.Э. Оценка гемостатической активности слизи кожи рыб in vitro. Актуальные вопросы ветеринарной биологии, 2018, № 4 (40), с. 7-11. [ Fomina L.L., Kulakova T.S., Zhunina O.A., Oshurkova Yu.L., Vaycel' A.E. Ocenka gemostaticheskoy aktivnosti slizi kozhi ryb in vitro. Aktual'nye voprosy veterinarnoy biologii, 2018, № 4 (40), s. 7-11. [ Козыренко Е.А., Оттесен О., Амин А. Особенности распределения и химического состава слизистых клеток в эпидермисе атлантической трески Gadus morhua L. Вестник МГТУ, 2010, т. 13, № 4/1, с. 655-660. Kozyrenko E.A., Ottesen O., Amin A. Osobennosti raspredeleniya i himicheskogo sostava slizistyh kletok v epidermise atlanticheskoy treski Gadus morhua L. Vestnik MGTU, 2010, t. 13, № 4/1, s. 655-660. Лебедева Н.Е., Головкина Т.В. Состав и некоторые свойства слизи растительноядных рыб как критерий стрессового состояния. Вестник Моск. Ун-та, 1987, сер. 16, № 4, c. 28-33. Lebedeva N.E., Golovkina T.V. Sostav i nekotorye svoystva slizi rastitel'noyadnyh ryb kak kriteriy stressovogo sostoyaniya. Vestnik Mosk. Un-ta, 1987, ser. 16, № 4, c. 28-33. Sangeetha Subramanian, Neil W Ross, Shawna L MacKinnon Comparison of antimicrobial activity in the epidermal mucus extracts of fish. Comparative Biochemistry and Phisiology Part B: Biochemistry and Molecular Biology, 2008, vol. 150(1), pp. 85-92. Sangeetha Subramanian, Neil W Ross, Shawna L MacKinnon Comparison of antimicrobial activity in the epidermal mucus extracts of fish. Comparative Biochemistry and Phisiology Part B: Biochemistry and Molecular Biology, 2008, vol. 150(1), pp. 85-92. Ellis A.E. Innate host defense mechanisms of fish against viruses and bacteria. Developmental & Comparative Immunology, 2001, no. 25, pp. 839. Ellis A.E. Innate host defense mechanisms of fish against viruses and bacteria. Developmental & Comparative Immunology, 2001, no. 25, pp. 839. Ingram G.A. Substances involved in the natural-resistance of fish to infection - a review. J. Fish Biol., 1980, no. 16, pp. 23-60. Ingram G.A. Substances involved in the natural-resistance of fish to infection - a review. J. Fish Biol., 1980, no. 16, pp. 23-60.