<!DOCTYPE article
PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.4 20190208//EN"
       "JATS-journalpublishing1.dtd">
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" article-type="research-article" dtd-version="1.4" xml:lang="en">
 <front>
  <journal-meta>
   <journal-id journal-id-type="publisher-id">Russian Journal of Biological Physics and Chemisrty</journal-id>
   <journal-title-group>
    <journal-title xml:lang="en">Russian Journal of Biological Physics and Chemisrty</journal-title>
    <trans-title-group xml:lang="ru">
     <trans-title>АКТУАЛЬНЫЕ ВОПРОСЫ БИОЛОГИЧЕСКОЙ ФИЗИКИ И ХИМИИ</trans-title>
    </trans-title-group>
   </journal-title-group>
   <issn publication-format="print">2499-9962</issn>
  </journal-meta>
  <article-meta>
   <article-id pub-id-type="publisher-id">54596</article-id>
   <article-categories>
    <subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru">
     <subject>Общая биофизика</subject>
    </subj-group>
    <subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en">
     <subject>General biophysics</subject>
    </subj-group>
    <subj-group>
     <subject>Общая биофизика</subject>
    </subj-group>
   </article-categories>
   <title-group>
    <article-title xml:lang="en">Comparison of conformational properties of antihypertensive peptide IRW and it isomer LRW</article-title>
    <trans-title-group xml:lang="ru">
     <trans-title>Сопоставление конформационных свойств ангигипертензивного пептида IRW и его изомера LRW</trans-title>
    </trans-title-group>
   </title-group>
   <contrib-group content-type="authors">
    <contrib contrib-type="author">
     <name-alternatives>
      <name xml:lang="ru">
       <surname>Агаева</surname>
       <given-names>Г А</given-names>
      </name>
      <name xml:lang="en">
       <surname>Agaeva</surname>
       <given-names>G A</given-names>
      </name>
     </name-alternatives>
     <email>gulshen@mail.ru</email>
     <xref ref-type="aff" rid="aff-1"/>
    </contrib>
    <contrib contrib-type="author">
     <name-alternatives>
      <name xml:lang="ru">
       <surname>Агаева</surname>
       <given-names>У. Т.</given-names>
      </name>
      <name xml:lang="en">
       <surname>Agaeva</surname>
       <given-names>U. T.</given-names>
      </name>
     </name-alternatives>
     <xref ref-type="aff" rid="aff-2"/>
    </contrib>
    <contrib contrib-type="author">
     <name-alternatives>
      <name xml:lang="ru">
       <surname>Годжаев</surname>
       <given-names>Н М</given-names>
      </name>
      <name xml:lang="en">
       <surname>Godjaev</surname>
       <given-names>N M</given-names>
      </name>
     </name-alternatives>
     <xref ref-type="aff" rid="aff-3"/>
    </contrib>
   </contrib-group>
   <aff-alternatives id="aff-1">
    <aff>
     <institution xml:lang="ru">Бакинский государственный университет</institution>
     <country>ru</country>
    </aff>
    <aff>
     <institution xml:lang="en">Baku State University</institution>
     <country>ru</country>
    </aff>
   </aff-alternatives>
   <aff-alternatives id="aff-2">
    <aff>
     <institution xml:lang="ru">Бакинский государственный университет</institution>
     <city>Баку</city>
     <country>Россия</country>
    </aff>
    <aff>
     <institution xml:lang="en">Baku State University</institution>
     <city>Baku</city>
     <country>Russian Federation</country>
    </aff>
   </aff-alternatives>
   <aff-alternatives id="aff-3">
    <aff>
     <institution xml:lang="ru">Бакинский государственный университет</institution>
     <country>ru</country>
    </aff>
    <aff>
     <institution xml:lang="en">Baku State University</institution>
     <country>ru</country>
    </aff>
   </aff-alternatives>
   <pub-date publication-format="print" date-type="pub" iso-8601-date="2021-03-25T20:22:29+03:00">
    <day>25</day>
    <month>03</month>
    <year>2021</year>
   </pub-date>
   <pub-date publication-format="electronic" date-type="pub" iso-8601-date="2021-03-25T20:22:29+03:00">
    <day>25</day>
    <month>03</month>
    <year>2021</year>
   </pub-date>
   <volume>6</volume>
   <issue>1</issue>
   <fpage>15</fpage>
   <lpage>19</lpage>
   <history>
    <date date-type="received" iso-8601-date="2021-03-20T20:22:29+03:00">
     <day>20</day>
     <month>03</month>
     <year>2021</year>
    </date>
    <date date-type="accepted" iso-8601-date="2021-03-20T20:22:29+03:00">
     <day>20</day>
     <month>03</month>
     <year>2021</year>
    </date>
   </history>
   <self-uri xlink:href="https://rusjbpc.ru/en/nauka/article/54596/view">https://rusjbpc.ru/en/nauka/article/54596/view</self-uri>
   <abstract xml:lang="ru">
    <p>Ангиотензин-превращающий фермент (АПФ) играет важную роль в системах контроля артериального давления (ренин-ангиотензиновая система), поскольку он превращает ангиотензин I в ангиотензин II (Ang II), что приводит к развитию гипертонии. Следовательно, очень важно изучить ингибирование АПФ для предотвращения и лечения гипертонии. Ингибиторы АПФ широко назначают при сердечно-сосудистых заболеваниях, включая высокое кровяное давление, сердечную недостаточность и почечную недостаточность. Пептиды, ингибирующие АПФ, являются более безопасными, чем синтетические ингибиторы АПФ, и могут быть полезными в качестве гипотензивных средств. В настоящей работе методами молекулярной механики исследовано пространственное строение и конформационное поведение антигипертензивного трипептида İRW и его изомера LRW, выделенных из пищевых белков. В результате расчетов было показано, что в слабополярной среде пептиды предпочтительно формируют похожие стабильные полностью свернутые структуры. Было показано, что предпочтительная конформация этих пептидов стабилизируется эффективными дисперсионными взаимодействиями с образованием водородной связи между атомами карбоксильной группы С-терминальной части и гуанидиновой группы боковой цепи аргинина. В результате сравнительного исследования двух структурно гомологичных трипептидов IRW и LRW были определены энергетически предпочтительные области величин двугранных углов и взаимное расположение остатков в низкоэнергетических конформациях молекул. На основе полученных параметров были составлены молекулярные модели энергетически предпочтительных конформаций трипептидов. Данное исследование позволило сопоставить все стабильные конформационные состояния двух трипептидных пептидов, что дает возможность выделить структурные критерии, возможно необходимые для создания ингибирующих свойств лекарственных препаратов для клинического использования.</p>
   </abstract>
   <trans-abstract xml:lang="en">
    <p>Angiotensin converting enzyme (ACE) plays an important role in blood pressure control systems (renin-angiotensin system) because it converts angiotensin I to angiotensin II (Ang II), which leads to the development of hypertension. Therefore, it is very important to study ACE inhibition for the prevention and treatment of hypertension. ACE inhibitors are widely prescribed for cardiovascular diseases, including high blood pressure, heart failure, and kidney failure. ACE inhibiting peptides are safer than synthetic ACE inhibitors and may be useful as antihypertensive agents. In this work, the spatial structure and conformational behavior of the antihypertensive tripeptide İRW and its isomer LRW, isolated from food proteins, have been studied using molecular mechanics methods. As a result of calculations, it was shown that, in a weakly polar environment, peptides preferentially form similar stable fully folded structures. It was shown that the preferred conformation of these peptides is stabilized by effective dispersion interactions with the formation of a hydrogen bond between the atoms of the carboxyl group of the C-terminal part and the guanidine group of the arginine side chain. As a result of a comparative study of two structurally homologous tripeptides IRW and LRW, the energetically preferred ranges of the dihedral angles and the mutual arrangement of residues in the low-energy conformations of molecules were determined. Based on the obtained parameters, molecular models of the energetically preferred conformations of the tripeptides were compiled. This study made it possible to compare all the stable conformational states of two tripeptide peptides, which makes it possible to identify structural criteria that may be necessary to create inhibitory properties of drugs for clinical use.</p>
   </trans-abstract>
   <kwd-group xml:lang="ru">
    <kwd>трипептиды</kwd>
    <kwd>ингибиторы АПФ</kwd>
    <kwd>изомеры</kwd>
    <kwd>конформация</kwd>
    <kwd>метод молекулярной механики</kwd>
   </kwd-group>
   <kwd-group xml:lang="en">
    <kwd>antihypertensive tripeptide</kwd>
    <kwd>angiotensin converting enzyme (ACE)</kwd>
    <kwd>conformation</kwd>
    <kwd>inhibitor</kwd>
    <kwd>molecular mechanics method</kwd>
   </kwd-group>
  </article-meta>
 </front>
 <body>
  <p></p>
 </body>
 <back>
  <ref-list>
   <ref id="B1">
    <label>1.</label>
    <citation-alternatives>
     <mixed-citation xml:lang="ru">
            
              Yamamoto N. Antihypertensive peptides derived from food proteins. Peptide Science, 1997, vol. 43, pp. 129-134.
            
          </mixed-citation>
     <mixed-citation xml:lang="en">
            
              Yamamoto N. Antihypertensive peptides derived from food proteins. Peptide Science, 1997, vol. 43, pp. 129-134.
            
          </mixed-citation>
    </citation-alternatives>
   </ref>
   <ref id="B2">
    <label>2.</label>
    <citation-alternatives>
     <mixed-citation xml:lang="ru">
            
              Liao W., Fan H., Wu J.J. Egg White-Derived Antihypertensive Peptide IRW (Ile-Arg-Trp) Inhibits Angiotensin II-Stimulated Migration of Vascular Smooth Muscle Cells via Angiotensin Type I Receptor. J Agric Food Chem., 2018, vol. 66, no. 20, pp. 5133-5138.
            
          </mixed-citation>
     <mixed-citation xml:lang="en">
            
              Liao W., Fan H., Wu J.J. Egg White-Derived Antihypertensive Peptide IRW (Ile-Arg-Trp) Inhibits Angiotensin II-Stimulated Migration of Vascular Smooth Muscle Cells via Angiotensin Type I Receptor. J Agric Food Chem., 2018, vol. 66, no. 20, pp. 5133-5138.
            
          </mixed-citation>
    </citation-alternatives>
   </ref>
   <ref id="B3">
    <label>3.</label>
    <citation-alternatives>
     <mixed-citation xml:lang="ru">
            
              Xiao Wang, Khushwant S. Bhullar, Hongbing Fan, Wang Liao, Yongjin Qiao, Di Su, Jianping Wu. Regulatory Effects of a Pea-Derived Peptide Leu-Arg-Trp (LRW) on Dysfunction of Rat Aortic Vascular Smooth Muscle Cells against Angiotensin II Stimulation. J Agric Food Chem., 2020, vol. 68, no. 13, pp. 3947-3953.
            
          </mixed-citation>
     <mixed-citation xml:lang="en">
            
              Xiao Wang, Khushwant S. Bhullar, Hongbing Fan, Wang Liao, Yongjin Qiao, Di Su, Jianping Wu. Regulatory Effects of a Pea-Derived Peptide Leu-Arg-Trp (LRW) on Dysfunction of Rat Aortic Vascular Smooth Muscle Cells against Angiotensin II Stimulation. J Agric Food Chem., 2020, vol. 68, no. 13, pp. 3947-3953.
            
          </mixed-citation>
    </citation-alternatives>
   </ref>
   <ref id="B4">
    <label>4.</label>
    <citation-alternatives>
     <mixed-citation xml:lang="ru">
            
              Агаева Г.А., Агаева У.Т., Годжаев Н.М. Особенности пространственной организации молекул гемокинина-1 человека и гемокинина-1 мыши/крысы. Биофизика, 2015, т. 60, вып. 3, с. 457-470. @@Agaeva G.A., Agaeva U.T., Godzhaev N.M. Features of the spatial organization of the molecules of human hemokinin-1 and mouse / rat hemokinin-1. Biophysics, 2015, vol. 60, no. 3, pp. 457-470. (In Russ.)
            
          </mixed-citation>
     <mixed-citation xml:lang="en">
            
              Agaeva G.A., Agaeva U.T., Godzhaev N.M. Osobennosti prostranstvennoy organizacii molekul gemokinina-1 cheloveka i gemokinina-1 myshi/krysy. Biofizika, 2015, t. 60, vyp. 3, s. 457-470. @@Agaeva G.A., Agaeva U.T., Godzhaev N.M. Features of the spatial organization of the molecules of human hemokinin-1 and mouse / rat hemokinin-1. Biophysics, 2015, vol. 60, no. 3, pp. 457-470. (In Russ.)
            
          </mixed-citation>
    </citation-alternatives>
   </ref>
   <ref id="B5">
    <label>5.</label>
    <citation-alternatives>
     <mixed-citation xml:lang="ru">
            
              IUPAC-IUB Commision on Biochemical Nomenclature Abbreviations and symbols for description of conformation of polypeptide chains. Pure Appl. Chem., 1974, vol. 40, pp. 291-308.
            
          </mixed-citation>
     <mixed-citation xml:lang="en">
            
              IUPAC-IUB Commision on Biochemical Nomenclature Abbreviations and symbols for description of conformation of polypeptide chains. Pure Appl. Chem., 1974, vol. 40, pp. 291-308.
            
          </mixed-citation>
    </citation-alternatives>
   </ref>
   <ref id="B6">
    <label>6.</label>
    <citation-alternatives>
     <mixed-citation xml:lang="ru">
            
              Максумов И.С., Исмаилова Л.И., Годжаев Н.М. Программа полуэмпирического расчета конформаций молекулярных комплексов на ЭВМ. Журнал структурной химии, 1983, т. 24, № 4, с. 147-148. @@Maksumov I.S., Ismailova L.I., Godzhaev N.M. Program for semi-empirical calculation of conformations of molecular complexes on a computer. Journal of Structural Chemistry, 1983, vol. 24, no. 4, pp. 147-148. (In Russ.)
            
          </mixed-citation>
     <mixed-citation xml:lang="en">
            
              Maksumov I.S., Ismailova L.I., Godzhaev N.M. Programma poluempiricheskogo rascheta konformaciy molekulyarnyh kompleksov na EVM. Zhurnal strukturnoy himii, 1983, t. 24, № 4, s. 147-148. @@Maksumov I.S., Ismailova L.I., Godzhaev N.M. Program for semi-empirical calculation of conformations of molecular complexes on a computer. Journal of Structural Chemistry, 1983, vol. 24, no. 4, pp. 147-148. (In Russ.)
            
          </mixed-citation>
    </citation-alternatives>
   </ref>
   <ref id="B7">
    <label>7.</label>
    <citation-alternatives>
     <mixed-citation xml:lang="ru">
            
              Chem 3D Pro, “Molecular Modeling and Analysis,” Cambridge Soft Corporation, 2005, 875 Massachusetts, 02139 U.S.A.
            
          </mixed-citation>
     <mixed-citation xml:lang="en">
            
              Chem 3D Pro, “Molecular Modeling and Analysis,” Cambridge Soft Corporation, 2005, 875 Massachusetts, 02139 U.S.A.
            
          </mixed-citation>
    </citation-alternatives>
   </ref>
  </ref-list>
 </back>
</article>
