Russian Journal of Biological Physics and Chemisrty Russian Journal of Biological Physics and Chemisrty АКТУАЛЬНЫЕ ВОПРОСЫ БИОЛОГИЧЕСКОЙ ФИЗИКИ И ХИМИИ 2499-9962 54604 Моделирование в биофизике Modelling in biophycis Моделирование в биофизике Spatial structure of casoxin a molecule Трехмерная структура молекулы казоксина А Ахмедов Н А Akhmedov N A namiq.49@bk.ru Агаева Л. Н. Agayeva L. N. leylanamig@mail.ru Аббаслы Р М Abbasli R M Исмаилова Л И Ismailova L I Бакинский государственный университет ru Baku State University ru Бакинский государственный университет Баку Азербайджан Baku State University Baku Azerbaijan Бакинский государственный университет ru Baku State University ru Бакинский государственный университет ru Baku State University ru 25 03 2021 25 03 2021 6 1 62 68 20 03 2021 20 03 2021 https://rusjbpc.ru/en/nauka/article/54604/view

Методом теopетического конформационного анализа исследованы конформационные возможности молекулы казоксина А (Tyr1-Pro2-Ser3-Tyr4-Gly5-Leu6-Asn7-NH2). Потенциальная функция системы выбрана в виде суммы невалентных, электростатических и торсионных взаимодействий и энергии водородных связей. Найдены низкоэнергетические конформации молекулы казоксина А, значения двугранных углов основных и боковых цепей аминокислотных остатков, входящих в состав молекулы, оценена энергия внутри- и межостаточных взаимодействий. Показано, что пространственная структура молекулы казоксина А представляется конформациями четырнадцати шейпов пептидного скелета. Полученные результаты могут быть использованы для выяснения структурной и структурно-функциональной организации молекул казоксинов.

By the method of the theoretic conformational analysis the conformational capabilities of the Casoxin A molecule (Tyr1-Pro2-Ser3-Tyr4-Gly5-Leu6-Asn7-NH2) were studied. The potential function of the system is chosen as the sum of non-valent, electrostatic and torsion interactions and the energy of hydrogen bonds. Low-energy conformations of the casoxin A molecule, the values of the dihedral angles of the main and side chains of amino acid residues that make up the molecules are founded; the energy of intra- and inter-residual interactions is estimated. It is shown that the spatial structure of the casoxin A molecule can be represented by the conformations of fourteen shapes of the peptide backbone. The results obtained can be used to elucidate the structural and structural-functional organization of casoxin molecules.

 экзорфин казоксин опиоид структура конформация exorphin casoxin opioid structure conformation

Чеснокова Е.А., Сарычева Н.Ю., Дубынин В.А., Каменский А.А. Опиоидные пептиды, получаемые с пищей и их влияние на нервную систему. Успехи физиологических наук, 2015, т. 46, № 1, с. 22-46. @@ Chesnokova E.A., Sarycheva N.Y., DubyninV.A., KamenskyA.A. Food-Derived Opioid Peptides and Their Neurological Impact. Advancesin Physiological Sciences, 2015, vol. 46, no. 1, pp. 22-46. (In Russ.) Chesnokova E.A., Sarycheva N.Yu., Dubynin V.A., Kamenskiy A.A. Opioidnye peptidy, poluchaemye s pischey i ih vliyanie na nervnuyu sistemu. Uspehi fiziologicheskih nauk, 2015, t. 46, № 1, s. 22-46. @@ Chesnokova E.A., Sarycheva N.Y., DubyninV.A., KamenskyA.A. Food-Derived Opioid Peptides and Their Neurological Impact. Advancesin Physiological Sciences, 2015, vol. 46, no. 1, pp. 22-46. (In Russ.) Соколов О.Ю., Кост Н. В., Андреева О.О., Корнеева Е.В., Мешавкин В.К., Тараканова Ю.Н., Золотарев Ю.А., Грачев С.А., Михеева И.Г., Зозуля А.А. Возможная роль казоморфинов в патогенезе аутизма. Психиатрия, 2010, т. 45, № 3, с. 29-35. @@ Sokolov O.Yu., Kost N.V., Andreeva O.O., Korneeva E.V., MeshavkinV.K., Tarakanova Yu.N., Zolotarev Yu.A., Grachev S.A., Mikheeva I.G., Zozulya A.A. The possibl eroleof casomorphin sinpathogenesis of autism. Psixiatriya, 2010, vol. 46, no. 3, pp. 29-35. (In Russ.) Sokolov O.Yu., Kost N. V., Andreeva O.O., Korneeva E.V., Meshavkin V.K., Tarakanova Yu.N., Zolotarev Yu.A., Grachev S.A., Miheeva I.G., Zozulya A.A. Vozmozhnaya rol' kazomorfinov v patogeneze autizma. Psihiatriya, 2010, t. 45, № 3, s. 29-35. @@ Sokolov O.Yu., Kost N.V., Andreeva O.O., Korneeva E.V., MeshavkinV.K., Tarakanova Yu.N., Zolotarev Yu.A., Grachev S.A., Mikheeva I.G., Zozulya A.A. The possibl eroleof casomorphin sinpathogenesis of autism. Psixiatriya, 2010, vol. 46, no. 3, pp. 29-35. (In Russ.) Sienkiewiez-Szlapka E., Jarmolowska B., Krawczuk S., Kostyara E. Contents of agonistic and antagonistic opioid peptides in different cheese varieties.Int. Dairy J., 2009, vol. 19, no. 4, pp. 258-263. Sienkiewiez-Szlapka E., Jarmolowska B., Krawczuk S., Kostyara E. Contents of agonistic and antagonistic opioid peptides in different cheese varieties.Int. Dairy J., 2009, vol. 19, no. 4, pp. 258-263. Ахмедов Н.А. Теоретический конформационный анализ молекул β-казоморфина, валмуцептина и морфицептина. Молекулярная Биология, 1989, т. 23, с. 240-248. @@ [Akhmedov N.A. Teoretical conformation analysis of β-cazomorphin, valmuceptin and morphiceptin molecules. Molecular. Biol., 1989, vol. 23, pp. 240-248. (In Russ.) Ahmedov N.A. Teoreticheskiy konformacionnyy analiz molekul β-kazomorfina, valmuceptina i morficeptina. Molekulyarnaya Biologiya, 1989, t. 23, s. 240-248. @@ [Akhmedov N.A. Teoretical conformation analysis of β-cazomorphin, valmuceptin and morphiceptin molecules. Molecular. Biol., 1989, vol. 23, pp. 240-248. (In Russ.) Ахмедов Н.А., Годжаев Н.М., Сулейманова Е.В., Попов Е.М. Структурная организация молекул [Met] энкефалина и эндорфинов. Биоорганическая химия, 1990, т. 16, с. 649-667. @@ Akhmedov N.A., Godjaev N.M., Suleymanova E.V., Popov E.M. Structural organization of the [Met] encephalin and endorphins molecules. Bioorganic chemistry, 1990, vol. 16, pp. 649-667. (In Russ.) Ahmedov N.A., Godzhaev N.M., Suleymanova E.V., Popov E.M. Strukturnaya organizaciya molekul [Met] enkefalina i endorfinov. Bioorganicheskaya himiya, 1990, t. 16, s. 649-667. @@ Akhmedov N.A., Godjaev N.M., Suleymanova E.V., Popov E.M. Structural organization of the [Met] encephalin and endorphins molecules. Bioorganic chemistry, 1990, vol. 16, pp. 649-667. (In Russ.) Akhmedov N.A., Agayeva L.N., Ismailova L.I., Godjaev N.M. Thespatial structure of the cardio active peptides. Current Topics in Peptide and Protein Research, 2010, vol. 11, pp. 87-93. Akhmedov N.A., Agayeva L.N., Ismailova L.I., Godjaev N.M. Thespatial structure of the cardio active peptides. Current Topics in Peptide and Protein Research, 2010, vol. 11, pp. 87-93. Гаджиева Ш.Н., Ахмедов Н.А., Масимов Э.А., Годжаев Н.М. Пространственная структура молекулы Thr-Pro-Ala-Glu-Asp-Phe-Met-Arg-Phe-NH2. Биофизика, 2013, т. 58, вып. 4, с. 587-590. @@ Gadjieva Sh.N., Akhmedov N.A., Masimov E.A., Godjaev N.M. Spatial Structure of Thr-Pro-Ala-Glu-Asp-Phe-Met-Arg-Phe-NH2. Biophysics, 2013, vol. 58, pp. 587-590. (In Russ.) Gadzhieva Sh.N., Ahmedov N.A., Masimov E.A., Godzhaev N.M. Prostranstvennaya struktura molekuly Thr-Pro-Ala-Glu-Asp-Phe-Met-Arg-Phe-NH2. Biofizika, 2013, t. 58, vyp. 4, s. 587-590. @@ Gadjieva Sh.N., Akhmedov N.A., Masimov E.A., Godjaev N.M. Spatial Structure of Thr-Pro-Ala-Glu-Asp-Phe-Met-Arg-Phe-NH2. Biophysics, 2013, vol. 58, pp. 587-590. (In Russ.) Akhmedov N.A., Ismailova L.I., Abbasli R.M. et al. Spatial Structure of Octarphin molecule. IOSR J. Applied Physics (IOSR-JAP), 2016, vol. 8, pp.66-70. Akhmedov N.A., Ismailova L.I., Abbasli R.M. et al. Spatial Structure of Octarphin molecule. IOSR J. Applied Physics (IOSR-JAP), 2016, vol. 8, pp.66-70. Hasanov E.M., Akhmedov N.A. Spatial Structure of Peptide BAM-20P.International Journal of Innovative Science and Research Technology, 2018, vol. 3, pp.72-76. ISSN: №4-2456-2165. Hasanov E.M., Akhmedov N.A. Spatial Structure of Peptide BAM-20P.International Journal of Innovative Science and Research Technology, 2018, vol. 3, pp.72-76. ISSN: №4-2456-2165. Akhmedov N.A., Abbasli R.M., Agayeva L.N., Ismailova L.I. Three-dimensional structure of exorpin B5 molecule. Conference proceedings Modern Trends In Physics, 2019, pp. 201-104. Akhmedov N.A., Abbasli R.M., Agayeva L.N., Ismailova L.I. Three-dimensional structure of exorpin B5 molecule. Conference proceedings Modern Trends In Physics, 2019, pp. 201-104. IUPAC-IUB. Quantities, Units and Symbols in Physical Chemistry, Blackwell Scientific, Oxford 1993. IUPAC-IUB. Quantities, Units and Symbols in Physical Chemistry, Blackwell Scientific, Oxford 1993.