Russian Journal of Biological Physics and Chemisrty Russian Journal of Biological Physics and Chemisrty АКТУАЛЬНЫЕ ВОПРОСЫ БИОЛОГИЧЕСКОЙ ФИЗИКИ И ХИМИИ 2499-9962 54823 10.29039/rusjbpc.2022.0487 Моделирование в биофизике Modelling in biophycis Моделирование в биофизике SPATIAL STRUCTURE OF ALFA-LAKTORFINE MOLECULE Пространственная структура молекулы альфа-лакторфина Ахмедов Н. А. Akhmedov N. A. Namiq.49@bk.ru Агаева Л. Н. Agayeva L. N. leylanamig@mail.ru Аббаслы Р. М. Abbasli R. M. Исмаилова Л. И. Ismailova L. I. lara.ismailova.52@mail.ru Бакинский государственный университет Баку Азербайджан Baku State University Baku Azerbaijan Бакинский государственный университет Баку Азербайджан Baku State University Baku Azerbaijan Бакинский государственный университет Баку Азербайджан Baku State University Baku Azerbaijan Бакинский государственный университет Баку Азербайджан Baku State University Baku Azerbaijan 25 03 2022 25 03 2022 7 1 81 86 20 03 2022 20 03 2022 https://rusjbpc.ru/en/nauka/article/54823/view

Опиоидные пептиды в настоящее время считаются наиболее изученной группой сигнальных веществ пептидной природы. Опиум вызывает обезболивание, успокоение и засыпание, также эйфорическое состояние и ряд вегетативных реакций. Опиоидные пептиды бывают животного и растительного происхождения. Ряд экзогенных пептидов, получаемых с пищей, обладают опиоидоподобными свойствами. Такие пептиды были названы экзорфинами, имеются десятки представителей. Молекула альфа-лакторфина является представителем этого класса. Методом теоретического конформационного анализа исследованы конформационные возможности молекулы альфа-лакторфина Tyr-Gly-Leu-Phe. Потенциальная функция системы выбрана в виде суммы невалентных, электростатических и торсионных взаимодействий и энергии водородных связей. Найдены низкоэнергетические конформации молекулы альфа-лакторфина, значения двугранных углов основных и боковых цепей аминокислотных остатков, входящих в состав молекул, оценена энергия внутри- и межостаточных взаимодействий. Показано, что пространственная структура молекулы альфа-лакторфина может быть представлена одиннадцатью формами основной цепи. Полученные результаты могут быть использованы для выяснения структурной и структурно-функциональной организации молекул экзорфинов.

Opioid peptides are currently considered the most studied group of peptide signaling substances. Opium causes pain relief, sedation and falling asleep, as well as a euphoric state and a number of vegetative reactions. Opioid peptides are of animal and plant origin. A number of exogenous peptides obtained from food have opioid-like properties. Such peptides were called exorphins, there are dozens of representatives. The alpha-laktorphine molecule is a representative of this class. The conformational possibilities of the Tyr-Gly-Leu-Phe alpha-lactorphine molecule were studied by the method of theoretical conformational analysis. The potential function of the system is chosen as the sum of non-valence, electrostatic and torsion interactions and the energy of hydrogen bonds. The low-energy conformations of the alpha-laktorphine molecule, the values of the dihedral angles of the main and side chains of the amino acid residues that make up the molecule were found, and the energy of intra- and interresidual interactions was estimated. It was shown that the spatial structure of the alpha-laktorphine molecule can be represented by eleven forms of the main chain. The results obtained can be used to elucidate the structural and structural-functional organization of exorphin molecules.

 экзорфин лакторфин опиоид структура конформация exorphin laktorphine opioid structure conformation

Чеснокова Е.А., Сарычева Н.Ю., Дубынин В.А., Каменский А.А. Опиоидные пептиды, получаемые с пищей и их влияние на нервную систему. Успехи физиологических наук, 2015, т. 46, № 1, с. 22-46. Chesnokova E.A., Sarycheva N.Y., Dubynin V.A., Kamensky A.A. Food-Derived Opioid Peptides and Their Neurological Impact. Advances in Physiological Sciences, 2015, vol. 46, no. 1, pp. 22-46. (In Russ.) Соколов О.Ю., Кост Н.В., Андреева О.О., Корнеева Е.В., Мешавкин В.К., Тараканова Ю.Н., Дадаян А.К., Золотарев Ю.А., Грачев С.А., Михеева И.Г., Зозуля А.А. Возможная роль казоморфинов в патогенезе аутизма. Психиатрия, 2010, т. 45, № 3, с. 29-35. [ Sokolov O.Yu., Kost N.V., Andreeva O.O., Korneeva E.V., Meshavkin V.K., Tarakanova Yu.N., Dadayan A.K., Zolotarev Yu.A., Grachev S.A., Mikheeva I.G., Zozulya A.A. Possible role of casomorphins in the pathogenesis of autism. Psychiatry, 2010, vol. 45, no. 3, pp. 29-35. (In Russ.) Sienkiewiez-Szlapka E., Jarmolowska B., Krawczuk S., Kostyara E. Contents of agonistic and antagonistic opioid peptides in different cheese varieties. Int. Dairy J., 2009, vol. 19, no. 4, pp. 258-263. Sienkiewiez-Szlapka E., Jarmolowska B., Krawczuk S., Kostyara E. Contents of agonistic and antagonistic opioid peptides in different cheese varieties. Int. Dairy J., 2009, vol. 19, no. 4, pp. 258-263. Ахмедов Н.А. Теоретический конформационный анализ молекул β-казоморфина, валмуцептина и морфицептина. Молекулярная Биология, 1989, т. 23, с. 240-248. Akhmedov N.A. Teoretical conformation analysis of β-cazomorphin, valmuceptin and morphiceptin molecules. Molecular. Biol., 1989, vol. 23, pp. 240-248. (In Russ.) Ахмедов Н.А., Годжаев Н.М., Сулейманова Е.В., Попов Е.М. Структурная организация молекул [Met] энкефалина и эндорфинов. Биоорганическая химия, 1990, т. 16, с. 649-667. Akhmedov N.A., Godjaev N.M., Suleymanova E.V., Popov E.M. Structural organization of the [Met] encephalin and endorphins molecules. Bioorganic chemistry, 1990, vol. 16, pp. 649-667. (In Russ.) Гаджиева Ш.Н., Ахмедов Н.А., Масимов Э.А., Годжаев Н.М. Пространственная структура молекулы Thr-Pro-Ala-Glu-Asp-Phe-Met-Arg-Phe-NH2. Биофизика, 2013, т. 58, № 4, с. 587-590. Gadjieva Sh.N., Akhmedov N.A., Masimov E.A., Godjaev N.M. Spatial Structure of Thr-Pro-Ala-Glu-Asp-Phe-Met-Arg-Phe-NH2. Biophysics, 2013, vol. 58, no. 4, pp. 587-590. (In Russ.) Akhmedov N.A., Ismailova L.I., Abbasli R.M. et al. Spatial Structure of Octarphin molecule. IOSR J. Applied. Physics (IOSR-JAP), 2016, vol. 8, pp. 66-70. Akhmedov N.A., Ismailova L.I., Abbasli R.M. et al. Spatial Structure of Octarphin molecule. IOSR J. Applied. Physics (IOSR-JAP), 2016, vol. 8, pp. 66-70. Ismailova L.I., Abbasli R.M., Akhmedov N. Computer Modeling of the Spatial Structure of Nonapeptide Molecule. COIA, 2020, vol. 1, pp. 218-221. Ismailova L.I., Abbasli R.M., Akhmedov N. Computer Modeling of the Spatial Structure of Nonapeptide Molecule. COIA, 2020, vol. 1, pp. 218-221. Akhmedov N.A., Agayeva L.N., Akverdieva G.A., Abbasli R.M., Ismailova L.I. Spatial structure of the ACTH-(6-9)-PGP molecule. J.Chem.Soc.Pak., 2021, vol. 43, no. 5, pp. 500-504. Akhmedov N.A., Agayeva L.N., Akverdieva G.A., Abbasli R.M., Ismailova L.I. Spatial structure of the ACTH-(6-9)-PGP molecule. J.Chem.Soc.Pak., 2021, vol. 43, no. 5, pp. 500-504. Akhmedov N.A., Agayeva L.N., Akhmedova S.R., Abbasli R.M., Ismailova L.I. Spatial structure of the β-Casomorphin-7 Molecule. IOSR Journal of Applied Physics (IOSR-JAP), 2021, vol. 13, pp. 62-67. doi: 10.9790/4861-1305026267. Akhmedov N.A., Agayeva L.N., Akhmedova S.R., Abbasli R.M., Ismailova L.I. Spatial structure of the β-Casomorphin-7 Molecule. IOSR Journal of Applied Physics (IOSR-JAP), 2021, vol. 13, pp. 62-67. doi: 10.9790/4861-1305026267. Agayeva L.N., Abdinova A.A., Akhmedova S.R., Akhmedov N.A. Spatial Structure of the ACTH-(7-10) Molecule. Biophysics, 2021, vol. 66, no. 4, pp. 531-534. Agayeva L.N., Abdinova A.A., Akhmedova S.R., Akhmedov N.A. Spatial Structure of the ACTH-(7-10) Molecule. Biophysics, 2021, vol. 66, no. 4, pp. 531-534. Akhmedov N.A., Abbasli R.M., Agayeva L.N., Ismailova L.I. Three-dimensional structure of exorpin B5 molecule. Conference proceedings. Modern Trends in Physics, 2019, pp. 201-104. Akhmedov N.A., Abbasli R.M., Agayeva L.N., Ismailova L.I. Three-dimensional structure of exorpin B5 molecule. Conference proceedings. Modern Trends in Physics, 2019, pp. 201-104. IUPAC-IUB. Quantities, Units and Symbols in Physical Chemistry. Oxford: Blackwell Scientific, 1993. IUPAC-IUB. Quantities, Units and Symbols in Physical Chemistry. Oxford: Blackwell Scientific, 1993.