Russian Journal of Biological Physics and Chemisrty Russian Journal of Biological Physics and Chemisrty АКТУАЛЬНЫЕ ВОПРОСЫ БИОЛОГИЧЕСКОЙ ФИЗИКИ И ХИМИИ 2499-9962 54153 МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОФИЗИКА И ФИЗИКА БИОМОЛЕКУЛ MOLECULAR BIOPHYSICS AND PHYSICS OF BIOMOLECULES МОЛЕКУЛЯРНАЯ БИОФИЗИКА И ФИЗИКА БИОМОЛЕКУЛ Structural studies of N-terminal domains of CTCF proteins from higher metazoans using smallangle X-Ray scattering (SAXS) Сравнительное исследование структур N-концевого мультимеризующего домена белков CTCF высших многоклеточных методом малоуглового рассеяния рентгеновских лучей (SAXS) Бончук А Н Bonchuk A N errinaceus@rambler.ru Качалова Г С Kachalova G S Бойко К М Boyko K M Максименко О Г Maksimenko O G Георгиев П Г Georgiev P G Институт биологии гена РАН ru Institute of gene biology RAS ru Институт биохимии им. А.Н. Баха, ФИЦ Биотехнологии РАН ru A.N. Bach Institute of biochemistry, Research Center of Biotechnology RAS ru Институт биохимии им. А.Н. Баха, ФИЦ Биотехнологии РАН ru A.N. Bach Institute of biochemistry, Research Center of Biotechnology RAS ru Институт биологии гена РАН ru Institute of gene biology RAS ru Институт биологии гена РАН ru Institute of gene biology RAS ru 25 06 2017 25 06 2017 2 1 209 211 20 06 2017 20 06 2017 https://rusjbpc.ru/en/nauka/article/54153/view

При помощи малоуглового рассеяния рентгеновских лучей (SAXS) получены данные о пространственной структуре N-концевых доменов инсуляторных белков CTCF представителей основных филогенетических групп высших многоклеточных. В отличие от N-концевого домена белка CTCF Drosophila , являющегося мультимером, аналогичные домены других животных не способны формировать олигомеры, большинство из них являются развернутыми. Таким образом, функция мультимеризации при помощи этого домена является уникальной для насекомых.

Spatial structure of N-terminal domains of CTCF insulator proteins from higher metazoans was studied using small-angle X-ray scattering (SAXS). In contrast to N-terminal domains of Drosophila CTCF protein, similar domains from other animals were unable to form oligomers and mainly are unfolded. Multimerization ability probably is unique for insects.

 мультимеризация малоугловое рассеяние рентгеновских лучей хроматин multimerization small-angle X-ray scattering chromatin

Kyrchanova O., Chetverina D., Maksimenko O., Kullyev A., Georgiev P. Orientation-dependent interaction between Drosophila insulators is a property of this class of regulatory elements. Nucleic Acids Res., 2008, vol. 36, iss. 22, pp. 7019-7028. Kyrchanova O., Chetverina D., Maksimenko O., Kullyev A., Georgiev P. Orientation-dependent interaction between Drosophila insulators is a property of this class of regulatory elements. Nucleic Acids Res., 2008, vol. 36, iss. 22, pp. 7019-7028. Moon H., Filippova G., Loukinov D., Pugacheva E., Chen Q., Smith S., Munhall A., Grewe B., Bartkuhn M., Arnold R. CTCF is conserved from Drosophila to humans and confers enhancer blocking of the Fab-8 insulator. EMBO Rep., 2005, vol. 6, iss. 2, pp. 165-170. Moon H., Filippova G., Loukinov D., Pugacheva E., Chen Q., Smith S., Munhall A., Grewe B., Bartkuhn M., Arnold R. CTCF is conserved from Drosophila to humans and confers enhancer blocking of the Fab-8 insulator. EMBO Rep., 2005, vol. 6, iss. 2, pp. 165-170. Bell A., West A., Felsenfeld G. The protein CTCF is required for the enhancer blocking activity of vertebrate insulators. Cell, 1999, vol. 98, iss. 3, pp. 387-396. Bell A., West A., Felsenfeld G. The protein CTCF is required for the enhancer blocking activity of vertebrate insulators. Cell, 1999, vol. 98, iss. 3, pp. 387-396. Kyrchanova O., Ivlieva T., Toshchakov S., Parshikov A., Maksimenko O., Georgiev P. Selective interactions of boundaries with upstream region of Abd-B promoter in Drosophila bithorax complex and role of dCTCF in this process. Nucleic Acids Res., 2011, vol. 39, pp. 3042-3052. Kyrchanova O., Ivlieva T., Toshchakov S., Parshikov A., Maksimenko O., Georgiev P. Selective interactions of boundaries with upstream region of Abd-B promoter in Drosophila bithorax complex and role of dCTCF in this process. Nucleic Acids Res., 2011, vol. 39, pp. 3042-3052. Pant V., Kurukuti S., Pugacheva E., Shamsuddin S., Mariano P., Renkawitz R., Klenova E., Lobanenkov V., Ohlsson R. Mutation of a single CTCF target site within the H19 imprinting control region leads to loss of Igf2 imprinting and complex patterns of de novo methylation upon maternal inheritance. Mol. Cell Biol., 2004, vol. 24, iss. 8, pp. 3497-3504. Pant V., Kurukuti S., Pugacheva E., Shamsuddin S., Mariano P., Renkawitz R., Klenova E., Lobanenkov V., Ohlsson R. Mutation of a single CTCF target site within the H19 imprinting control region leads to loss of Igf2 imprinting and complex patterns of de novo methylation upon maternal inheritance. Mol. Cell Biol., 2004, vol. 24, iss. 8, pp. 3497-3504. Bonchuk A., Maksimenko O., Kyrchanova O., Ivlieva T., Mogila V., Deshpande G., Wolle D., Schedl P., Georgiev P. Functional role of dimerization and CP190 interacting domains of CTCF protein in Drosophila melanogaster. BMC Biol., 2015, vol. 13, no. 63. Bonchuk A., Maksimenko O., Kyrchanova O., Ivlieva T., Mogila V., Deshpande G., Wolle D., Schedl P., Georgiev P. Functional role of dimerization and CP190 interacting domains of CTCF protein in Drosophila melanogaster. BMC Biol., 2015, vol. 13, no. 63. Martinez S., Miranda J. CTCF terminal segments are unstructured. Protein Sci., 2010, vol. 19, iss. 5, pp. 1110-1116. Martinez S., Miranda J. CTCF terminal segments are unstructured. Protein Sci., 2010, vol. 19, iss. 5, pp. 1110-1116.