Russian Journal of Biological Physics and Chemisrty Russian Journal of Biological Physics and Chemisrty АКТУАЛЬНЫЕ ВОПРОСЫ БИОЛОГИЧЕСКОЙ ФИЗИКИ И ХИМИИ 2499-9962 54287 Моделирование в биофизике Modelling in biophycis Моделирование в биофизике MODELING THE STACKING INTERACTIONS OF FLAVIN-MONONUCLEOTIDE WITH THE NITROGENOUS BASES OF DNA МОДЕЛИРОВАНИЕ СТЭКИНГ-ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ ФЛАВИН-МОНО-НУКЛЕОТИДА С АЗОТИСТЫМИ ОСНОВАНИЯМИ ДНК Мухина Ю В Mukhina U V onica@rambler.ru Севастопольский государственный университет ru Sevastopol State Univercity ru 25 06 2018 25 06 2018 3 2 320 326 20 06 2018 20 06 2018 https://rusjbpc.ru/en/nauka/article/54287/view

Исследован механизм взаимодействия флавин-мононуклеотида (FMN) с азотистыми основаниями ДНК и с фрагментом ДНК. Полу- и неэмпирическими методами рассчитаны наиболее вероятные структуры комплексов FMN с основаниями, с парами оснований и с фрагментом ДНК. Определены структурные и термодинамические параметры комплексов FMN с парами оснований ДНК. Установлен вклад различных физико-химических сил взаимодействия в стабилизацию комплексов молекул. Сделаны выводы о молекулярном механизме взаимодействия FMN с основаниями ДНК.

The mechanism of the interaction flavin-mononucleotide (FMN) with bases DNA and with fragment DNA were explored. The most probable structures complex FMN with bases, with pair of the bases and with fragment DNA have been calculated by means of semi- and nonempirical methods. Structures and thermodynamic parameters of complex FMN with pair of the bases DNA have been determined. The contribution of different physical-chemical forces of the interaction in stabilization complexes of molecules has been installed. Сonclusion about molecular mechanism of the interaction FMN with bases DNA has been made.

 флавин-мононуклеотид азотистые основания ДНК полу- и неэмпирические методы дисперсионное взаимодействие интеркаляция flavin-mononucleotide bases DNK semi- and nonempirical methods dispersion interaction intercalation

Davies D.B., Veselkov D.A., Djimant L.N., Veselkov A.N. Hetero-association of caffeine and aromatic drugs and their competitive binding with a DNA oligomer. Eur. Biophys. J., 2001, vol. 30, pp. 354-366. Davies D.B., Veselkov D.A., Djimant L.N., Veselkov A.N. Hetero-association of caffeine and aromatic drugs and their competitive binding with a DNA oligomer. Eur. Biophys. J., 2001, vol. 30, pp. 354-366. Lubas B., Soltysik M. Proton NMR study of the interaction of riboflavin with the egg-yolk apoprotein. FEBS Letters., 1977, vol. 79, no. 1, pp. 179-182. Lubas B., Soltysik M. Proton NMR study of the interaction of riboflavin with the egg-yolk apoprotein. FEBS Letters., 1977, vol. 79, no. 1, pp. 179-182. Monaco H.L. Crystal structure of chicken riboflavin-binding protein. EMBO J., 1997, vol. 16, no. 7, pp. 1475-1483. Monaco H.L. Crystal structure of chicken riboflavin-binding protein. EMBO J., 1997, vol. 16, no. 7, pp. 1475-1483.