Russian Journal of Biological Physics and Chemisrty Russian Journal of Biological Physics and Chemisrty АКТУАЛЬНЫЕ ВОПРОСЫ БИОЛОГИЧЕСКОЙ ФИЗИКИ И ХИМИИ 2499-9962 54288 Моделирование в биофизике Modelling in biophycis Моделирование в биофизике CONFORMATIONAL PARTICULARITIES OF TWO ENDOGENOUS PEPTIDES MIF-1 AND TYR-MIF-1 КОНФОРМАЦИОННЫЕ ОСОБЕННОСТИ ДВУХ ЭНДОГЕННЫХ ПЕПТИДОВ МОЗГА MIF-1 И TYR-MIF-1 Агаева Г А Agaeva G A gulshen@mail.ru Бабаева М Н Babaeva M N Бакинский государственный университет; Бакинский инженерный университет ru Baku State University; Baku Engineering University ru Бакинский инженерный университет ru Baku Engineering University ru 25 06 2018 25 06 2018 3 2 327 330 20 06 2018 20 06 2018 https://rusjbpc.ru/en/nauka/article/54288/view

Пространственное строение и конформационные особенности двух эндогенных пептидов меланостатина (МИФ-1, ингибирующий фактор меланоцитстимулирующего гормона) и Tyr - MIF - 1 [Tyr-Pro-Leu-Gly-NH2] были исследованы методом теоретического конформационного анализа. Как показал расчет проcтранственное строение молекул можно описать в виде ограниченного набора низкоэнергетических конформаций. Было показано, что для данных родственных молекул энергетически наиболее предпочтительными оказались конформации, характеризующиеся квазициклической структурой. Для каждой оптимальной конформации были определены величины двугранных углов основной и боковых цепей и оценены энергетические вклады внутри и межостаточных взаимодействий во всех оптимальных конформациях пептидов. Сопоставление геометрических и энергетических параметров стабильных структур двух пептидов мозга позволило выявить конформационно подвижные и консервативные участки молекул.

By theoretical conformational analysis method have been investigated the spatial structure and conformational properties of Pro-Leu-Gly-NH2-melanocyte-stimulating hormone-release-inhibiting factor (MIF-1) and Tyr - MIF - 1 [Tyr-Pro-Leu-Gly-NH2]. Conformational analysis indicate that the spatial structure of these can be described by set of low-energy conformations. It is shown that each of endogenous peptides forms energetically favoured conformations with compact quasicyclic structure. Calculations produced the values of all dihedral angles of the backbones and side chains and also intra- and inter-residue interactions energy contributions at the preferred conformations of peptides. The comparison of the geometric and energetic parameters of stable conformations of two brain peptides permit to determine the conformational flexible and conservative segments of molecules.

 меланостатина (МИФ-1 ингибиpующий фaктop мeлaнoцитcтимулиpующeгo гopмoнa) Tyr-MIF-1 [Tyr-Pro-Leu-Gly-NH2] конформация теоретический конформационный анализ Pro-Leu-Gly-NH2-melanocyte-stimulating hormone-release-inhibiting factor (MIF-1) Tyr-MIF-1 [Tyr-Pro-Leu-Gly-NH2] conformation theoretical conformational analysis

Kastin A.J., Pan W. MIF-1/Tyr-MIF-1. Handbook of Biologically Active Peptides (Second Edition), 2013, 2032 p. Kastin A.J., Pan W. MIF-1/Tyr-MIF-1. Handbook of Biologically Active Peptides (Second Edition), 2013, 2032 p. Petersheim M.I., Moldow R.L., Halladay H.N., Kastin A.J., Fischman A.J. Conformational studies of N-Tyr-MIF-1 in aqueous solution by 1H nuclear magnetic resonance spectroscopy. Int J Pept Protein Res., 1992, vol. 40(1), pp. 41-8. Petersheim M.I., Moldow R.L., Halladay H.N., Kastin A.J., Fischman A.J. Conformational studies of N-Tyr-MIF-1 in aqueous solution by 1H nuclear magnetic resonance spectroscopy. Int J Pept Protein Res., 1992, vol. 40(1), pp. 41-8. Xu D. Preliminary report on the effect of PLG (MIF-1) in the treatment of Parkinson's disease. Acta Universitatis Medicinalis Secondae Shanghai, 1986, vol. 6, pp. 328-329. Xu D. Preliminary report on the effect of PLG (MIF-1) in the treatment of Parkinson's disease. Acta Universitatis Medicinalis Secondae Shanghai, 1986, vol. 6, pp. 328-329. Khan R.S., Yu C., Kastin A.J., He Y., Ehrensing R.H., Hsuchou H., Stone K.P., Pan W. Brain Activation by Peptide Pro-Leu-Gly-NH2 (MIF-1). International Journal of Peptides, 2010, vol. 7, no. 5, pp. 112-118. Khan R.S., Yu C., Kastin A.J., He Y., Ehrensing R.H., Hsuchou H., Stone K.P., Pan W. Brain Activation by Peptide Pro-Leu-Gly-NH2 (MIF-1). International Journal of Peptides, 2010, vol. 7, no. 5, pp. 112-118. Kastin A.J., Pan W. Concepts for Biologically Active Peptides. Curr Pharm Des., 2010, vol. 16(30), pp. 3390-3400. Kastin A.J., Pan W. Concepts for Biologically Active Peptides. Curr Pharm Des., 2010, vol. 16(30), pp. 3390-3400. Pan W., Kastin A.J. From MIF-1 to endomorphin: the Tyr-MIF-1 family of peptides. Peptides, 2007, vol. 12, pp. 2411-34. Pan W., Kastin A.J. From MIF-1 to endomorphin: the Tyr-MIF-1 family of peptides. Peptides, 2007, vol. 12, pp. 2411-34. Popov E.M. Quantative approach to conformations. Int. J. Quantum Chem., 1979, vol. 16, pp. 707-737. Popov E.M. Quantative approach to conformations. Int. J. Quantum Chem., 1979, vol. 16, pp. 707-737. Maksumov I.S., Ismailova L.I., Godjaev N.M. The program for semiempirical calculation of conformations of the molecular complexes. Russ. J. Struct. Khim., 1983, vol. 24, pp. 147-148. Maksumov I.S., Ismailova L.I., Godjaev N.M. The program for semiempirical calculation of conformations of the molecular complexes. Russ. J. Struct. Khim., 1983, vol. 24, pp. 147-148. Agaeva G.A., Agaeva U.T., Godjaev N.M, The spatial organization of human hemokinin-1 and mouse/rat hemokinin-1 molecules. Russ. Biophysics, 2015, vol. 60, pp. 365-377. Agaeva G.A., Agaeva U.T., Godjaev N.M, The spatial organization of human hemokinin-1 and mouse/rat hemokinin-1 molecules. Russ. Biophysics, 2015, vol. 60, pp. 365-377. IUPAC-IUB Commission on Biochemical Nomenclature. Abbreviations.and. symbols for the di script ion of the conformation, of poly-peptide chains. Biochem. Biophys. Acta., 1971, vol. 229, pp. 1-17. IUPAC-IUB Commission on Biochemical Nomenclature. Abbreviations.and. symbols for the di script ion of the conformation, of poly-peptide chains. Biochem. Biophys. Acta., 1971, vol. 229, pp. 1-17.