Методом главных компонент проведен анализ экспериментальных значений химических сдвигов необменивающихся протонов само- и несамокомплементарных дезоксиолигонуклеотидов различного состава и последовательности оснований в цепи. Выявлены признаки, наиболее существенно влияющие на магнитное экранирование протонов оснований рассмотренных коротких фрагментов ДНК.
дезоксиолигонуклеотид, химический сдвиг, триплет, главные компоненты
1. Веселков А.Н., Дэвис Д., Дымант Л.Н., Паркес Х. 1М- и 2М- 1Н-ЯМР исследование самоассоциации дезокситетрануклеозидтрифосфатов различной последовательности оснований в водном растворе. Биополимеры и клетка, 1991, т. 7, № 5, с. 15-22. [Veselkov A.N., Daviеs D., Djimant L. N., Parkes H. 1D- and 2D- 1H NMR investigation of self-association of deoxytetranucleotides of different base sequence in aqueous solution. Biopolymers and Cell, 1991, vol. 7, no. 5, рр. 15-22. (In Russ.)]
2. Веселков А.Н., Пахомов В.И., Итон Р., Дэвис Д. ЯМР-исследование самоассоциации молекул дезоксигексануклеотидов 5¢-d(CpGpTpApCpG) и 5¢-d(CpGpCpGpCpG) в водном растворе. Биофизика, 2000, т. 45, с. 20-26. [Veselkov A.N., Pahomov V.I., Eaton R., Daviеs D. NMR investigation of self-association of hexadeoxynucleotides 5¢-d(CpGpTpApCpG) and 5¢-d(CpGpCpGpCpG) in aqueous solution. Biophysics, 2000, vol. 45, рр. 20-26. (In Russ.)]
3. Daviеs B.D., Pahomov V.I., Veselkov A.N. NMR determination of the conformation and drug binding properties of the DNA heptamer d(GpCpGpАpАpGpC) in aqueous solution. Nucleic Acids Res., 1997, vol. 25, pр. 4523-4531.
4. Altona C, Faber D.H., Westra Hoekzema A.J.A. Double-helical DNA 1H chemical shifts: an accurate and balanced predictive empirical scheme. Magn. Reson. Chem., 2000, vol.38, pр.95-107.
5. Эсбенсен К. Анализ многомерных данных, сокр. пер. с англ. под ред. О. Родионовой, Изд-во ИПХФ РАН, 2005, 204с. [Esbensen K.H. Multivariate Data Analysis, abbr. per. from English. ed. О. Rodionova, ICP RAS, 2005, 204 p. (In Russ.)]
