При помощи методов кругового дихроизма и малоуглового рассеяния рентгеновских лучей (SAXS) получены данные о пространственной структуре мультимеризующего N-концевого домена инсуляторного белка CTCF Drosophila melanogaster . По аминокислотной последовательности данный домен не имеет гомологии ни с одним известным белковым доменом. По данным кругового дихроизма N-концевой домен белка CTCF Drosophila практически не имеет вторичной структуры. По данным SAXS этот домен имеет стабильную компактную структуру в растворе и является тетрамером. Получены модели низкого разрешения структуры тетрамера в растворе. Формирование тетрамеров также подтверждается при помощи методов динамического рассеяния света (DLS) и гель-фильтрации.
мультимеризация, малоугловое рассеяние рентгеновских лучей, круговой дихроизм, хроматин
1. Kyrchanova O., Chetverina D., Maksimenko O., Kullyev A., Georgiev P. Orientation-dependent interaction between Drosophila insulators is a property of this class of regulatory elements. Nucleic Acids Res., 2008, vol. 36 (22), pp. 7019-7028.
2. Moon H., Filippova G., Loukinov D., Pugacheva E., Chen Q., Smith S., Munhall A., Grewe B., Bartkuhn M., Arnold R. CTCF is conserved from Drosophila to humans and confers enhancer blocking of the Fab-8 insulator. EMBO Rep., 2005, vol. 6 (2), pp. 165-170.
3. Bell A., West A., Felsenfeld G. The protein CTCF is required for the enhancer blocking activity of vertebrate insulators. Cell, 1999, vol. 98 (3), pp. 387-396.
4. Kyrchanova O., Ivlieva T., Toshchakov S., Parshikov A., Maksimenko O., Georgiev P. Selective interactions of boundaries with upstream region of Abd-B promoter in Drosophila bithorax complex and role of dCTCF in this process. Nucleic Acids Res., 2011, vol. 39, pp. 3042-3052.
5. Pant V., Kurukuti S., Pugacheva E., Shamsuddin S., Mariano P., Renkawitz R., Klenova E., Lobanenkov V., Ohlsson R. Mutation of a single CTCF target site within the H19 imprinting control region leads to loss of Igf2 imprinting and complex patterns of de novo methylation upon maternal inheritance. Mol. Cell Biol., 2004, vol. 24 (8), pp. 3497- 3504.
6. Bonchuk A., Maksimenko O., Kyrchanova O., Ivlieva T., Mogila V., Deshpande G., Wolle D., Schedl P., Georgiev P. Functional role of dimerization and CP190 interacting domains of CTCF protein in Drosophila melanogaster. BMC Biol., 2015, vol. 13, p. 63.
7. Martinez S., Miranda J. CTCF terminal segments are unstructured. Protein Sci., 2010, vol. 19 (5), pp. 1110-1116.
