CLAMP - транскрипционный фактор Drosophila, участвующий в привлечении комплекса дозовой компенсации на специфические сайты ДНК. При помощи малоуглового рассеяния рентгеновских лучей (SAXS) получены данные о пространственной структуре N-концевого домена данного белка, содержащего домен типа «цинковый палец» и прилежащую аминокислотную последовательность с неизвестной структурой. Для этого домена ранее была показана способность к гомо-димеризации и взаимодействию с комплексом дозовой компенсации. Домен типа «цинковый палец» важен для функциональной активности N-концевого домена. Данные SAXS подтверждают, что N-концевой домен CLAMP является димером, свернут и имеет компактную симметричную структуру.
мультимеризация, малоугловое рассеяние рентгеновских лучей, хроматин
1. Kuroda M.I., Hilfiker A., Lucchesi J.C. Dosage Compensation in Drosophila-a Model for the Coordinate Regulation of Transcription. Genetics, 2016, vol. 204, pp. 435-450.
2. Hallacli E., Lipp M., Georgiev P., Spielman C., Cusack S., Akhtar A., Kadlec J. Msl1-mediated dimerization of the dosage compensation complex is essential for male X-chromosome regulation in Drosophila. Mol Cell, 2012, vol. 48, pp.587-600.
3. Kadlec J., Hallacli E., Lipp M., Holz H., Sanchez-Weatherby J., Cusack S., Akhtar A. Structural basis for MOF and MSL3 recruitment into the dosage compensation complex by MSL1. Nat. Struct. Mol. Biol., 2011, vol. 18, pp. 142-149.
4. Alekseyenko A.A., Ho J.W., Peng S., Gelbart M., Tolstorukov M.Y., Plachetka A., Kharchenko P.V., Jung Y.L., Gorchakov A.A., Larschan E. Sequence-specific targeting of dosage compensation in Drosophila favors an active chromatin context. PLoS Genet., 2012, vol. 8, e1002646.
5. Straub T., Zabel A., Gilfillan G.D., Feller C., Becker P.B. Different chromatin interfaces of the Drosophila dosage compensation complex revealed by high-shear ChIP-seq. Genome Res., 2013, vol. 23, pp. 473-485.
6. Straub T., Grimaud C., Gilfillan G.D., Mitterweger A., Becker P.B. The chromosomal high-affinity binding sites for the Drosophila dosage compensation complex. PLoS Genet, 2008, e1000302.
7. Larschan E., Soruco M.M., Lee O.K., Peng S., Bishop E., Chery J., Goebel K., Feng J., Park P.J., Kuroda M.I. Identification of chromatin-associated regulators of MSL complex targeting in Drosophila dosage compensation. PLoS Genet., 2012, vol. 8, e1002830.
8. Marcela М.I., Chery J., Bishop E.P., Siggers T., Tolstorukov M.Y., Leydon A.R., Sugden A.U., Goebel K., Feng J., Xia P., Vedenko.A, Bulyk М.I., Park P.J. and Larschan E. The CLAMP protein links the MSL complex to the X chromosome during Drosophila dosage compensation. Genes & development, 2013, vol. 27, pp. 1551-1556.
