В данной работе осуществлено выделение и анализ пептидной фракции секреторной жидкости клария угревидного (Clarias gariepinus). Выделение осуществлялось методами переосаждения и сопровождалось промежуточными очистками на сорбентах. Пептидная природа выделенной фракции подтверждалась методом ИК-спектроскопии. Масс-спектрометрический анализ пептидной фракции экстракта секреторной жидкости показал, что в составе преобладают хорошо удерживаемые пептиды с молекулярной массой 2000-3000 Да, а также более короткие гидрофильные пептиды. Последовательности пептидов определяли с помощью программного обеспечения Proteome Discoverer 1.4. (Thermo Scientific) с использованием базы данных аминокислотных последовательностей UniProt (uniprot-catfish+AND+organism__Clarias+gariepinus+ [13013]). Программно было найдено 14547 пепидных последовательностей, относящимся к 131 группе белков. Показано, что экстракт секреторной жидкости содержит большое количество пептидов, относящихся к различным классам белков протеома Clarias gariepinus (бета-актины, семейство цитохрома, белки теплового шока, миостатин, НАДН-дегидрогеназный комплекс и др.), которые определяют широкий набор биологических свойств, характерных для кожного секрета рыбы. Дальнейшее изучение кожного секрета клария угревидного представляется перспективным в плане фракционирования пептидного пула и определения фармакологической активности более узких фракций.
кларий угревидный, кожный секрет, пептидные фракции, масс-спектрометрия, секвенирование
1. Артеменко К.А., Самгина Т.Ю., Дойл Дж Р., Льюеллин Л.Е., Билусич Д., Бови Дж Х., Лебедев А.Т. Защитные пептиды, выделенные из кожного секрета европейской озерной лягушки Rana ridibunda. Масс-спектрометрия, 2007, т. 4 (2), с. 79-88.
2. Xiao Mei Wang, Wei Dai, Ke Zhing Xing,Tian Jun Li, Xin Wang Antibacterial activities of antibacterial proteins/peptides isolated from organs and mucus of Clarias gariepunus reared at high stocking density. Advanced Materials Research, 2012, pp. 455-460.
3. Chen Cheng-xun Research on the isolation and purification of antimicrobial peptide in the surface mucus of catfish body and its antimicrobial activity. J. of Anhui Agricultural Sciences, vol. 26, 2010.
4. Tingtin Li, Quanwei Liu, Dangfeng Wang, Jianrong Li Characterization and antimicrobial mechanism of CF-14, a new antimicrobial peptide from the epidermal mucus of catfish. Fish and shellfish immunology, vol. 92, 2019, pp. 881-888.
5. Фомина Л.Л., Кулакова Т.С., Жунина О.А., Ошуркова Ю.Л., Вайцель А.Э. Оценка гемостатической активности слизи кожи рыб in vitro. Актуальные вопросы ветеринарной биологии, 2018, № 4 (40), с. 7-11. [
6. Козыренко Е.А., Оттесен О., Амин А. Особенности распределения и химического состава слизистых клеток в эпидермисе атлантической трески Gadus morhua L. Вестник МГТУ, 2010, т. 13, № 4/1, с. 655-660.
7. Лебедева Н.Е., Головкина Т.В. Состав и некоторые свойства слизи растительноядных рыб как критерий стрессового состояния. Вестник Моск. Ун-та, 1987, сер. 16, № 4, c. 28-33.
8. Sangeetha Subramanian, Neil W Ross, Shawna L MacKinnon Comparison of antimicrobial activity in the epidermal mucus extracts of fish. Comparative Biochemistry and Phisiology Part B: Biochemistry and Molecular Biology, 2008, vol. 150(1), pp. 85-92.
9. Ellis A.E. Innate host defense mechanisms of fish against viruses and bacteria. Developmental & Comparative Immunology, 2001, no. 25, pp. 839.
10. Ingram G.A. Substances involved in the natural-resistance of fish to infection - a review. J. Fish Biol., 1980, no. 16, pp. 23-60.
