Баку, Азербайджан
Методом теopетического конформационного анализа исследованы конформационные возможности молекулы цитохрофина 4 (Tyr1-Pro2-Phe3-Thr4). Потенциальная функция системы выбрана в виде суммы невалентных, электростатических и торсионных взаимодействий и энергии водородных связей. Найдены низкоэнергетические конформации молекулы, значения двугранных углов основных и боковых цепей аминокислотных остатков, входящих в состав молекулы, оценена энергия внутри- и межостаточных взаимодействий. Показано, что пространственная структура молекулы цитохрофина 4, представляется конформациями четырех шейпов пептидного скелета. Полученные результаты могут быть использованы для выяснения структурной и структурно-функциональной организации молекул цитохрофинов.
экзорфин, цитохрофин, опиоид, структура, конформация
1. Чеснокова Е.А., Сарычева Н.Ю., Дубынин В.А., Каменский А.А. Опиоидные пептиды, получаемые с пищей и их влияние на нервную систему. Успехи физиологических наук, 2015, т. 46, № 1, с. 22-46. @@Chesnokova E.A., Sarycheva N.Y., DubyninV.A., KamenskyA.A. Food-Derived Opioid Peptides and Their Neurological Impact. Advancesin Physiological Sciences, 2015, vol. 46, no. 1, pp. 22-46. (In Russ.)
2. Соколов О.Ю., Кост Н. В., Андреева О.О., Корнеева Е.В., Мешавкин В.К., Тараканова Ю.Н., Золотарев Ю.А., Грачев С.А., Михеева И.Г., Зозуля А.А. Возможная роль казоморфинов в патогенезе аутизма. Психиатрия, 2010, т. 45, № 3, с. 29-35. @@Sokolov O.Yu., Kost N.V., Andreeva O.O., Korneeva E.V., MeshavkinV.K., Tarakanova Yu.N., Zolotarev Yu.A., Grachev S.A., Mikheeva I.G., Zozulya A.A. The possibl eroleof casomorphin sinpathogenesis of autism. Psixiatriya, 2010, vol. 46, no. 3, pp. 29-35. (In Russ.)
3. Lew R.A., Mustafa T., Ye S. et al. Angiotensin AT4 ligands are potent, competitive inhibitors of insulin regulated aminopeptidase (IRAP). J. of Neurochemistry, 2003, vol. 86, no. 2, pp. 344-350.
4. Ахмедов Н.А. Теоретический конформационный анализ молекул β-казоморфина, валмуцептина и морфицептина. Молекулярная Биология, 1989, т. 23, с. 240-248. @@[Akhmedov N.A. Teoretical conformation analysis of β-cazomorphin, valmuceptin and morphiceptin molecules. Molecular. Biol., 1989, vol. 23, pp. 240-240. (In Russ.)
5. Ахмедов Н.А., Годжаев Н.М., Сулейманова Е.В., Попов Е.М. Структурная организация молекул [Met] энкефалина и эндорфинов. Биоорганическая химия, 1990, т. 16, с. 649-667. @@Akhmedov N.A., Godjaev N.M., Suleymanova E.V., Popov E.M. Structural organization of the [Met] encephalin and endorphins molecules. Bioorganic chemistry, 1990, vol. 16, pp. 649-667. (In Russ.)
6. Akhmedov N.A., Agayeva L.N., Ismailova L.I., Godjaev N.M. Thespatial structure of the cardio active peptides. Current Topics in Peptide and Protein Research, 2010, vol. 11, pp. 87-93.
7. Гаджиева Ш.Н., Ахмедов Н.А., Масимов Э.А., Годжаев Н.М. Пространственная структура молекулы Thr-Pro-Ala-Glu-Asp-Phe-Met-Arg-Phe-NH2. Биофизика, 2013, т. 58, вып. 4, с. 587-590. @@Gadjieva Sh.N., Akhmedov N.A., Masimov E.A., Godjaev N.M. Spatial Structure of Thr-Pro-Ala-Glu-Asp-Phe-Met-Arg-Phe-NH2. Biophysics, 2013, vol. 58, pp. 587-590. (In Russ.)
8. Akhmedov N.A., Ismailova L.I., Abbasli R.M. et al. Spatial Structure of Octarphin molecule. IOSR J. Applied Physics (IOSR-JAP), 2016, vol. 8, pp. 66-70.
9. Hasanov E.M., Akhmedov N.A. Spatial Structure of Peptide BAM-20P.International Journal of Innovative Science and Research Technology, 2018, iss. no. 4-2456-2165, vol. 3, pp. 72-76.
10. Akhmedov N.A., Abbasli R.M., Agayeva L.N., Ismailova L.I. Three-dimensional structure of exorpin B5 molecule. Conference proceedings Modern Trends In Physics, 2019, pp. 201-104.
11. IUPAC-IUB. Quantities, Units and Symbols in Physical Chemistry, Blackwell Scientific, Oxford 1993.
