В данной работе методом молекулярной механики ММ+ исследованы динамические свойства молекул аллатостатинов, выявлены устойчивые элементы пространственной структуры, проведена количественная оценка пределов изменения двугранных углов основной цепи пептидных молекул в процессе динамических перестроек. Полуэмпирическим методом квантовой химии MNDO в стандартной параметризации было исследовано также электронное строение аллатостатинов и проведен сопоставительный анализ полученных результатов.
аллатостатины, пространственная структура, электронное строение, динамические свойства
1. Veelaert D., Devreese B., Schoofs L. et al. Izolation and characterization of eight myoinhibiting peptides from the desert locust, Schistocerca gregaria: new members of the cockroach allatostatin family. Mol. Cell Endocrinol., 1996, vol. 122, no. 2, pp.183-190.
2. Veelaert D., Devreese B., Schoofs L. et al. Izolation and characterization of schistostatin-2 (11-18) from the desert locust, Schistocerca gregaria: a truncated analog of schistostatin-2. Regulatory peptides, 1996, vol. 67, no. 3, pp. 195-199.
3. Bendena W.G., Donly B.C., Tobe S.S. Allatostatins: A growing family of neuropeptides with structural and functional diversity. Ann.N.-Y.Academy of Sciences, 1999, vol. 897, pp. 311-329.
4. Edwards J.P., Audsley N., Marris G.C., Weaver R. The role of allatostatic and allatropic neuropeptides in the regulation of juvenile hormone biosynthesis in Lacanbia oleracea. Peptides, 2001, vol. 22, no. 2, pp. 255-261.
5. Шноль Э.Э., Гривцов А.Г. и др. Метод молекулярной динамики в физической химии. М.: Наука, 1996.
6. Шайтан К.В., Сарайкин С.С. Метод молекулярной динамики. 1999. http://www.moldyn.ru/library/md/default.htm
8. Велиева Л.И., Мусаев М.А., Алиева И.Н. Структурное исследование молекулы аллатостатина-II. В материалах Международной научной Конференции Молекулярные, мембранные и клеточные основы функционирования биосистем, Минск, Беларусь, 2006, с. 111-113. @@Velieva L.I., Musaev M.A., Alieva I.N. Structural study of the allatostatin-II molecule. In the materials of the International Scientific Conference Molecular, membrane and cellular foundations of the functioning of biosystems, Minsk, Belarus, 2006, pp. 111-113. (In Russ.)
9. Alieva I.N., Veliyeva L.I., Musayev M.A., Gojayev N.M. Conformational features of the Dippu-AST 8 neuropeptide from Cockroach Diploptera punctata. Protein and Peptide Letters, 2006, vol. 13, pp. 1007-1015.
10. Мусаев М.А., Велиева Л.И., Алиева И.Н., Годжаев Н.М. Пространственная структура нейропептида аллатостатина-4. Вестник Бакинского Университета, серия физ-мат. наук, 2005, № 2, с. 167-178. @@Musaev M.A., Velieva L.I., Alieva I.N., Godzhaev N.M. Spatial structure of the neuropeptide allatostatin-4. Bulletin of Baku University, Phys. nauk, 2005, no. 2, pp. 167-178. (In Russ.)
11. Велиева Л.И., Мусаев М.А., Алиева И.Н., Годжаев Н.М. Молекулярная динамика нейропептидов семейства аллатостатинов. Вестник Бакинского Университета, серия физ-мат. наук, 2006, № 1, с. 120-131. @@Velieva L.I., Musaev M.A., Alieva I.N., Godzhaev N.M. Molecular dynamics of neuropeptides of the allatostatin family. Bulletin of Baku University, Phys. nauk, 2006, no. 1, pp. 120-131. (In Russ.)
