Пространственное строение и конформационные особенности двух эндогенных пептидов меланостатина (МИФ-1, ингибирующий фактор меланоцитстимулирующего гормона) и Tyr - MIF - 1 [Tyr-Pro-Leu-Gly-NH2] были исследованы методом теоретического конформационного анализа. Как показал расчет проcтранственное строение молекул можно описать в виде ограниченного набора низкоэнергетических конформаций. Было показано, что для данных родственных молекул энергетически наиболее предпочтительными оказались конформации, характеризующиеся квазициклической структурой. Для каждой оптимальной конформации были определены величины двугранных углов основной и боковых цепей и оценены энергетические вклады внутри и межостаточных взаимодействий во всех оптимальных конформациях пептидов. Сопоставление геометрических и энергетических параметров стабильных структур двух пептидов мозга позволило выявить конформационно подвижные и консервативные участки молекул.
меланостатина (МИФ-1, ингибиpующий фaктop мeлaнoцитcтимулиpующeгo гopмoнa), Tyr-MIF-1 [Tyr-Pro-Leu-Gly-NH2], конформация, теоретический конформационный анализ
1. Kastin A.J., Pan W. MIF-1/Tyr-MIF-1. Handbook of Biologically Active Peptides (Second Edition), 2013, 2032 p.
2. Petersheim M.I., Moldow R.L., Halladay H.N., Kastin A.J., Fischman A.J. Conformational studies of N-Tyr-MIF-1 in aqueous solution by 1H nuclear magnetic resonance spectroscopy. Int J Pept Protein Res., 1992, vol. 40(1), pp. 41-8.
3. Xu D. Preliminary report on the effect of PLG (MIF-1) in the treatment of Parkinson's disease. Acta Universitatis Medicinalis Secondae Shanghai, 1986, vol. 6, pp. 328-329.
4. Khan R.S., Yu C., Kastin A.J., He Y., Ehrensing R.H., Hsuchou H., Stone K.P., Pan W. Brain Activation by Peptide Pro-Leu-Gly-NH2 (MIF-1). International Journal of Peptides, 2010, vol. 7, no. 5, pp. 112-118.
5. Kastin A.J., Pan W. Concepts for Biologically Active Peptides. Curr Pharm Des., 2010, vol. 16(30), pp. 3390-3400.
6. Pan W., Kastin A.J. From MIF-1 to endomorphin: the Tyr-MIF-1 family of peptides. Peptides, 2007, vol. 12, pp. 2411-34.
7. Popov E.M. Quantative approach to conformations. Int. J. Quantum Chem., 1979, vol. 16, pp. 707-737.
8. Maksumov I.S., Ismailova L.I., Godjaev N.M. The program for semiempirical calculation of conformations of the molecular complexes. Russ. J. Struct. Khim., 1983, vol. 24, pp. 147-148.
9. Agaeva G.A., Agaeva U.T., Godjaev N.M, The spatial organization of human hemokinin-1 and mouse/rat hemokinin-1 molecules. Russ. Biophysics, 2015, vol. 60, pp. 365-377.
10. IUPAC-IUB Commission on Biochemical Nomenclature. Abbreviations.and. symbols for the di script ion of the conformation, of poly-peptide chains. Biochem. Biophys. Acta., 1971, vol. 229, pp. 1-17.
