Впервые рассмотрена динамика супрамолекулярных топологически ассоциированных ансамблей (Нп-нуклеоплазмы, ХрI-хроматина непрочно- и ХрII-прочносвязанного с ядерным матриксом и самого ЯМ), на поверхности раздела которых, представлена супер молекулярная реорганизация негистонового и гистонового протеома интерфазной-гетерополимерной хроматиновой матрицы, макрокинетика которого имеет важное значение для понимания особенностей биохимических процессов в переходный период от гетеротрофного к автотрофному развитию растений. Приведенные данные могут быть интересны биофизикам и тем, кто занимается разработкой логико-математических схем теории и практики биологической специфичности и могут войти в базу данных онтологии стадий роста и развития кариогеномных растений.
Протеомика, Интерфазная топология ядра, Супрамолекулярная биохимия, Кариогеномика, пшеница, сигнальные системы
1. Барлоу П.У. Деление клеток в меристемах и значение этого процесса для органогенеза и формообразования растений. Онтогенез, 1994, № 25 (5), с. 5-38. @@[Barlou P.U. Cell division in meristems and the importance of this process for plant organogenesis and morphogenesis. Ontouenez, 1994, vol. 25 (5), pp. 5-38. (In Russ.)]
2. Гладышев Г.П. Мысленно заглянул в космос. Наука в России, 1993, т. (3/4), с. 14-19. @@[Gladichov G.P. Mentally looked into space. Science in Russia, 1993, vol. (3/4), pp. 14-19. (In Russ.)]
3. Гельфанд М.С. Эволюция регуляторных систем. Материалы докладов V съезда биофизиков России. Ростов -на-Дону: Издательство Южного федерального университета, 2015, т. 1, с. 19. @@[Gelfand M.C. The evolution of regulatory systems. Materials of reports of the V Congress of Biophysicists of Russia. Rostov-on-Don: Publishing House of the Southern Federal University, 2015, vol. 1, p. 19. (In Russ.)]
4. Иванова Э.А. Особенности «структурированных процессов» в интерфазных ядрах у пшеницы, выведенной в условиях холодового стресса. Экобиотех, 2019, т. 2 (4), с. 1-6. @@[Ivanova E.A. Features of “structured processes” in interphase nuclei in wheat, bred under conditions of cold stress. Ecobiotech, 2019, vol. 2 (4), pp. 1-6, DOI:https://doi.org/10.31163/2618-964X-2019-2-4-000-000 (In Russ.)]
5. Иванова Э.А., Ахметов Р.Р. Модификация негистоновых белков в проростках растений. Физиология растений, 1987, т. 34 (3), с. 507-512. @@[Ivanova E.A., Akhmetov R.R. Modification of non-histon proteins in plant seedlings. Physiology plant, 1987, vol. 34 (3), pp. 507-512. (In Russ.)]
6. Иванова Э.А., Вафина Г.Х. Антиоксидантная активность пероксидазной системы надмолекулярных структур клеточных ядер в постэмбриональной фазе онтогенеза пшеницы. Вести национальной академии наук Беларуси, серия биологических наук, 1999, т. 2, с. 25-29. @@[Ivanova E.A., Vafina G.Ch. Antioxidant activity of the peroxidase system of the supramolecular structures of cell nuclei in the postembryonic phase of ontogenesis of wheat. Vesti nacional'noj akademii nauk Belarusi, seriya biologicheskih nauk, 1999, vol. 2, pp. 25-29. (In Russ.)]
7. Иванова Э.А., Вафина Г.Х. Анализ надмолекулярных структур клеточного ядра при активации хроматина. Доклады Академии Наук, 2006, т. 406(3), с. 419-421. @@[Ivanova E.A., Vafina G.Ch. Analysis of supramolecular structures of the cell nucleus upon chromatin activation. Reports of the Academy of Sciences, 2006, vol. 406(3), pp. 419-421. (In Russ.)]
8. Иванова Э.А., Вафина Г.Х., Иванов Р.С. Анализ локализации протеазочувствительных сайтов Арг-Х в динамике супраструктур интерфазного хроматина при индукции ростового морфогенеза зрелых зародышей яровой и озимой пшеницы. Физиология и генетика, 2014, т. 46 (3), c. 202-211. @@[Ivanova E.A., Vafina G.Ch., Ivanov R.C. Analysis of the localization of protease-sensitive sites of Arg-X in the dynamics of interphase chromatin suprastructures during the induction of growth morphogenesis of mature embryos of spring and winter wheat. Physiology and Genetics, 2014, vol. 46 (3), pp. 202-211. (In Russ.)]
9. Иванова Э.А., Вафина Г.Х., Ямалеев А.М. Исследование функциональной активности клеточных ядер при патогенезе пшеницы. Микология и фитопатология, 1989, т. 23 (2), с. 141-146. @@[Ivanova E.A., Vafina G.Ch., Ymaleev A.M. The study of the functional activity of cell nuclei in the pathogenesis of wheat. Mycology and phytopathology, vol. 23 (2), pp. 141-146. (In Russ.)]
10. Иванова Э.А., Гилязетдинов Ш.Я., Ахметов Р.Р. Модификация гистонов растений и влияние фитогормонов на интенсивность этого процесса. Растительные белки и их биосинтез. М.: Наука, 1975, c. 301-305. @@[Ivanova E.A., Gilyzitdinov Ch.Y., Akhmetov R.R. Modification of plant histones and the effect of phytohormones on the intensity of this process. Plant proteins and their biosynthesis. M.: Science, 1975, pp. 301-305. (In Russ.)]
11. Колесникова Т.Д. Механизмы пространственно-временной регуляции репликации. Молекулярная биология, 2013, т. 47 (1), с. 12-37. @@[Kolesnicova T.D. Mechanisms of spatio-temporal regulation of replication. Molecular biology, 2013, vol. 47 (1), pp. 12-37. (In Russ.)]
12. Конарев В.Г. Цитохимия и гистохимия растений. М.: Высшая школа, 1966. @@[Konarev V.G. Cytochemistry and histochemistry of plants. Israel program for scientific translation, Jerusalem, 1972].
13. Конарев В.Г. Морфогенез растений и молекулярно-биологический анализ. Санкт-Петербург: РАСХН, ВИР им. Н.И. Вавилова, 1998, 370 с. @@[Konarev V.G. Morphogenesis and molecular-biological analysis of plants. Sanct Peterburg, VIR, 1998, 370 p. (In Russ.)]
14. Лен Ж.-М. Супрамолекулярная химия. Новосибирск: Наука, 1998, 333 с. @@[Lehn J.-M. Supramolecular chemistry. Novosibirsk: Science, 1998, 333 p. (In Russ.)]
15. Разин С.В. Структурно-функциональная организация клеточного ядра и регуляция транскрипции: вводные замечания к специальному выпуску журнала. Биохимия, 2018, т. 83, с. 437-439. @@[Razin C.V. Structural and functional organization of the cell nucleus and regulation of transcription: introductory notes to the special issue of the journal. Biochemistry, 2018, vol. 83, pp. 437-439. (In Russ.)]
16. Разин С.В, Гаврилов А.А. Структурно-функциональные домены эукариотического генома. Биохимия, 2018, т. 83, с. 440-451. @@[Razin C.V., Gavrilov A.A. Structurally functional domains of the eukaryotic genome. Biochemistry, 2018, vol. 83, pp. 440-451. (In Russ.)]
17. Разин С.В., Гаврилов А.А., Кос П., Ульянов С.В. Самоорганизация хроматиновой фибриллы в топологически-ассоциированные домены. Биоорганическая химия, 2017, т. 43 (2), с. 115-123. @@[Razin C.V., Gavrilov A.A., Koc P., Ulyanov C.V. Self-organization of chromatin fibrils into topologically associated domains. Bioorganic chemistry, 2017, vol. 43 (2), pp. 115-123. (In Russ.)]
18. Стид Дж. В., Этвуд Дж., Л. Супрамолекулярная химия (супрамолекулярная биохимия). М.: ИКЦ «Академкнига», 2007, т. 2, 416 с. @@[Stid D.V., Etvud D.L. Supramolecular chemistry (supramolecular biochemistry). M.: IKC, Academic book, 2007, vol. 2, 416 p. (In Russ.)]
19. Том Р. Структурная устойчивость и морфогенез. М.: Логос, 2002, 280 с. @@[Tom R. Structural Stability and Morphogenesis. M.: Logos, 2002, 280 p. (In Russ.)]
20. Финкельштейн А.В., Птицин О.Б. Физика белка. Москва: Книжный дом, 2005, 460 с. @@[Finkelstein A.V., Ptitsin O.B. Physics of protein. Moscow: Book house, 2005, 460 p. (In Russ.)]
21. Шабарина А.Н., Глазков М.В. Барьерные элементы хроматиновых доменов и ядерная оболочка. Генетика, 2013, т. 49 (1), с. 30-36. @@[Shabarina A.N., Glazkov M.V. Barrier elements of chromatin domains and nuclear envelope. Genetics, 2013, vol. 49 (1), pp. 30-36. (In Russ.)]
22. Шайтан К.В. Фундаментальные закономерности формирования пространственных структур конформационно подвижных молекул. Сборник научных трудов VI съезда биофизиков России. Сочи: Кубанский государственный университет, 2019, т. 1, c. 36. @@[Shaitan K.V. The fundamental laws of the formation of spatial structures of conformationally mobile molecules. Collection of scientific papers of the VI Congress of Biophysicists of Russia. Sochi: Kuban State University, 2019, vol. 1, p. 36. (In Russ.)]
23. Ivanova E.A. Аrg-Х proteo-processing as model system for organization of karyogenomics Interphase chromatin of mature germs of wheats, formed in the conditions of cold stress. Journal of Stress Physiology & Biochemistry, 2017, vol. 13 (4), pp. 65-73. (In Russ.)
24. Ivanova E.A. Anterograde to adjusting, as system organization to localization of Arg-X of, proteo-processing in the topological associated ensembles of karyogenomics suprastructure interphase nucleus, at induction of growth morphogenesis of mature germs of wheat. Journal of applied microbiology and biochemistry, 2018, vol. 2 (1:4).
25. Ivanova E.A. On the question of epigenetic mechanisms of kariogenomic winter wheat in the concept of supramolecular biochemistry. Journal of Stress Physiology & Biochemistry, 2019, vol. 15 (3), pp. 14-20. (In Russ.).
26. Ivanova E.A., Vafina G.H., Ivanov R.S. Initial morphogenetic features of proteome of suprastructures of interphase chromatin for germination of mature germs in conditions of adapting to winter in wheat. Journal of stress physiology and biochemistry, 2015, vol. 11 (4), pp. 29-42. (In Russ.)
27. Schubert I., Shaw P. Organization and dynamics of plant interphase chromosomes. Trends in plant science, 2011, vol. 16 (5), pp. 273-281.
28. Smith K.L., De Lange R.J., Bonner J. Chemistry and biology of the histones. Physiol. Revs., 1970, vol. 50 (2), pp. 159-170.
29. Spicer S. High-mobility group chromosomal proteins of wheat. The journal of biological chemistry, 1984, vol. 259 (19), pp. 12007-12013.
30. Tropberger P., Schneider R. Scratching the (lateral) surface of chromatin regulation by histone modifications. Nature structural and molecular biology, 2013, vol. 20 (6).
