Уфа, Республика Башкортостан, Россия
В ракурсе экологической адаптации растений, с позиции междисциплинарной науки - супрамолекулярной химии , рассмотрена динамика супрамолекулярных топологически ассоциированных структур тотальной хроматиновой матрицы (ТХМ): Нп-нуклеоплазмы, ХрI-хроматина непрочно- и ХрII-прочносвязанного с ядерным матриксом и самого ЯМ. На поверхности раздела которых, представлена протеомная супер молекулярная реорганизация негистоновых и гистоновых ансамблей протеома ТХМ, макрокинетика которого имеет важное значение для понимания особенностей биохимических процессов в генетических подсистемах растения (корень→мезокотиль→колеоптиль) переходного периода от гетеротрофного к автотрофному развитию растений. Показан алгоритм динамики протеомных супер молекулярных ансамблей на поверхности раздела супрамолекулярных структур ТХМ. Выявлена позиционирующая роль «коровых» гистоновых (Н3+Н4)ꞌꞌ ансамблей в супра-блоках: Нп, Хр-II, ЯМ у озимого фенотипа, в зоне гомеоморфизма (по топологической терминологии Р. Тома) корневой системы, как интегративной стабилизации пространственно-временной, физиолого-генетической стрессоустойчивости организма относительно яровой пшеницы. Приведённые данные могут быть интересны биофизикам и войти в базу данных онтологии стадий роста и развития стрессоустойчивости растений в окружающей среде.
Протеомика, интерфазная топология хроматина, супрамолекулярная биохимия, пшеница, генетическая стрессоустойчивость
1. Лен Ж-М. Супрамолекулярная химия. Новосибирск, Наука, 1998, 333 с. @@Lehn J.-M., Supramolecular chemistry. Novosibirsk, Science, 1998, 333 p. (In Russ.)
2. Иванова Э.А. Особенности «структурированных процессов» в интерфазных ядрах у пшеницы, выведенной в условиях холодового стресса. Экобиотех, 2019, т. 2, № 4, с. 1-6. DOI: 10.3 1163/2618-964X-2019-2-4-000-000 @@Ivanova E.A. Features of "structured processes" in interphase nucleus wheat bred under cold stress. Ecobiotech, 2019, vol. 2, no. 4, 1-6. (In Russ.)
3. Иванова Э.А. Биофизическая экология в ракурсе концепции супрамолекулярной биохимии. Актуальные вопросы биологической физики и химии, 2020, т. 5, № 1, с. 194-200. @@Ivanova E.A. Biophysical ecology from the perspective of the concept of supramolecular biochemistry.Russian journal of biological physics and chemistry, 2020, vol. 5, no. 1, pp. 194-200. (In Russ.)
4. Иванова Э.А. Биофизическая экология в ракурсе концепции супрамолекулярной биохимии. Материалы ХV международной научной конференции «Актуальные вопросы биологической физики и химии». Севастополь, 2020, c. 179-180. @@Ivanova E.A. Biophysical ecology from the perspective of the concept of supramolecular biochemistry. Proceedings of the XV international scientific conference "Modern trends of biological physics and chemistry." Sevastopol, 2020, pp. 179-180. (In Russ.)
5. Ivanova E.A. Аrg-Х proteo-processing as model system for organization of karyogenomics Interphase chromatin of mature germs of wheats, formed in the conditions of cold stress. Journal of Stress Physiology & Biochemistry, 2017, vol. 13, no. 4, pp. 65-73.
6. Ivanova E.A. On the question of epigenetic mechanisms of kariogenomic winter wheat in the concept of supramolecular biochemistry. Journal of Stress Physiology & Biochemistry, 2019, vol. 15, no. 3, pp. 14-20.
7. Ivanova E.A. Analysis of the proteomics of chromatin suprastructures as areas of replication (origins) and perception of signal and stress systems in the development of spring wheat. Journal of Stress Physiology & Biochemistry, 2020, vol. 16, no. 4, pp. 22-34.
8. Ivanova E.A. Stress resistance on the example of supramolecular-genetic level of plant development. Journal of Stress Physiology & Biochemistry, 2021. submitted to the press.
9. Шайтан К.В. Фундаментальные закономерности формирования пространственных структур конформационно подвижных молекул. Сборник научных трудов VI съезда биофизиков России. Сочи: Кубанский государственный университет, 2019, том 1, c. 36. @@Shaitan K.V. The fundamental laws of the formation of spatial structures of conformationally mobile molecules. Collection of scientific papers of the VI Congress of Biophysicists of Russia. Sochi: Kuban State University, 2019, vol. 1, p. 36. (In Russ.)
10. Том Р. Структурная устойчивость и морфогенез. М.: Логос, 2002, 280 с. @@Tom R. Structural Stability and Morphogenesis. M.: Logos, 2002, 280 p. (In Russ.)
11. Белоусов Л.В. Биологический морфогенез. М.: МГУ, 1987, 234 с. @@Belousov L.V. Biological morphogenesis. M: Moscow State University, 1987, 234 p. (In Russ.)
12. Белоусов Л.В. Морфомеханический аспект эпигенеза. Генетика, 2006, т. 42, № 9, c. 1165-1169. @@Belousov L.V. Morphomechanical aspect of epigenesis. Genetics, 2006, vol. 42, no. 9, pp. 1165-1169. (In Russ.)
13. Барлоу П.У. Деление клеток в меристемах и значение этого процесса для органогенеза и формообразования растений. Онтогенез, 1994, т. 25, № 5, с. 5-38. @@Barlou P.U. Cell division in meristems and the importance of this process for plant organogenesis and morphogenesis. Ontogenesis, 1994, vol. 25, no. 5, pp. 5-38. (In Russ.)
14. Mistelli T., Spector D.L. The Nucleus. New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2011.
15. Галимзянов А.В., Ступак Е.Э., Чураев Р.Н. Эпигенные сети, теория, модели, эксперимент. Успехи современной биологии, 2019, т. 139, № 2, c. 107-113. @@Galimzyanov A.V., Stupak E.E., Churaev R.N. Epigenetic networks, theory, models, experiment. Advances in modern biology, 2019, vol. 139, no. 2, pp. 107-113. (In Russ.)
16. Лобов В.П., Даскалюк А.П. Сравнительное исследование ДНК озимых и яровых форм пшеницы. Докл. АН СССР, 1984, том 275, № 1, с. 218-221. @@Lobov V.P., Daskalyuk A.P.Comparative study of the DNA of winter and spring forms of wheat. Dokl. Academy of Sciences of the USSR, 1984, vol. 275, no. 1, pp. 218-221. (In Russ.)
17. Чураев Р.Н. Эпигенетика: генные и эпигенные сети в онто- и филогенезе. Генетика, 2006, т. 42, № 9, с. 1276-1296. @@Churaev R.N. Epigenetics: gene and epigenetic networks in ontogeny and phylgenesis. Genetics, 2006, vol. 42, no. 9, pp. 1276-1296. (In Russ.)
18. Smith E.L., De Lange R.J., Bonner J. Chemistry and biology of the histones. Physiol. Revs., 1970, vol. 50, no. 2, pp. 159-170.
19. Гельфанд М.С. Эволюция регуляторных систем. Материалы докладов V съезда биофизиков России. Ростов-на-Дону: Издательство Южного федерального университета, 2015, т. 1, с. 19. @@Gelfand M.C. The evolution of regulatory systems. Materials of reports of the V Congress of Biophysicists of Russia. Rostov-on-Don: Publishing House of the Southern Federal University, 2015, vol. 1, p. 19. (In Russ.)
20. Финкельштейн А.В., Птицин О.Б. Физика белка. Москва: Книжный дом, 2005, 460 с. @@Finkelstein A.V., Ptitsin O.B. Physics of protein. Moscow: Book house, 2005, 460 p. (In Russ.)
21. Иванова Э.А., Ахметов Р.Р. Модификация негистоновых белков в проростках растений. Физиология растений, 1987, т. 34, № 3, с. 507-512. @@Ivanova E.A, Akhmetov R.R. Modification of non-histon proteins in plant seedlings. Physiology plants, 1987, vol. 34, no. 3, pp. 507-512. (In Russ.)
22. Robin H. Epigenetics. An overview. Dev. Genet., 1994, vol. 15, no. 6, pp. 453-457.
23. Конарев В.Г. Морфогенез растений и молекулярно-биологический анализ. Санкт-Петербург: РАСХН, ВИР им. Н.И.Вавилова, 1998, 370 с. @@Konarev V.G. Morphogenesis and molecular-biological analysis of plants. Saint-Peterburg, VIR, 1998, 370 p. (In Russ.)
