Баку, Азербайджан
Баку, Азербайджан
Баку, Азербайджан
Актуальным представляется проведение структурно-функциональных исследований глипролинов и их синтетических аналогов на модельных системах с помощью теоретических методов исследования. Глипролины – семейство коротких пептидов, аминокислотные последовательности которых содержат остатки глицина и пролина. Механизмы их действия мало изучены. Большой интерес к их структуре вызван необходимостью создания новых лекарственных препаратов, которые являются собственным резервом человеческого организма. Такие пептидные молекулы отличаются высокой стабильностью и эффективностью. С помощью метода молекулярной механики было определено пространственное строение и конформационные свойства глипролиновой пентапептидной молекулы Arg- Glu-Arg-Gly-Pro. Потенциальная энергия молекулы оценивалась как сумма невалентных, электростатических, торсионных взаимодействий и энергии водородных связей. Найдены 9 низкоэнергетических конформаций для этого пентапептида, значения двугранных углов основной и боковых цепей, оценена энергия внутри- и межостаточных взаимодействий. Расчет показал, что низкоэнергетическими для пентапептида являются полусвернутые формы основной цепи. Боковые цепи аминокислот Arg и Glu в низкоэнергетических конформациях осуществляют эффективные взаимодействия и являются конформационно лабильными аминокислотами, они сближают участки основной цепи и боковые цепи аминокислот, входящих в пентапептид.
молекула, пространственная структура, пентапептид, конформация
1. Falaliyeva T.M., Samonina G.E., Beregovaya T.V. et all. Effects of glyprolines PGP, PG and GP on homeostasis of gastric mucosa in rats with experimental ethanol-induced gastric ulcers. Bull. Exp. Biol. Med., 2010, vol. 149, no. 6, pp. 699-701.
2. Мартынова К.В., Андреева Л.А., Климова П.А. и др. Структурно-функциональные исследования глицин и пролин содержащих пертидов, являющихся нейропротекторами. Биоорг. хим., 2009, т. 35. № 2, с. 165-171.
3. Umarova B.A., Kopylova G.N., Smirnova E.L. et al. Secretory Activity of Mast Cell during Stress: Effect of Prolyl-Glycyl-Proline and Simax. Bullet. of Exper. Biology and Medicine, 2003, vol. 136, no. 4, pp. 325-327.
4. Рогозинская Э.Я., Ляпина Л.А., Шубина Т.А., Мясоедов Н.Ф., Григорьева М.Е., Оберган Т.Ю., Андреева Л.А. Тромбоэластографическое исследование аргининсодержащих, лейцинсодержащих и лизинсодержащих пептидов. Бюллетень экспериментальной биологии и медицины, 2020, т. 169, с. 716-719.
5. Жуйкова С.Е. Глипролины - регуляторные пептиды с интегративным действием. Интегративная физиология, 2020, т. 1, № 6, с. 303-316. [Juykova S.E. Glyprolines - regulatory peptides with integrative action. Integrative physiology, 2020, vol. 1, no. 6, pp. 303-316. (In Russ.)].
6. Grigoryeva M., Shubina T., Obergan T., Lyapina L. Hema Sphere Peptides PGP and RERPGP increase NO metabolites and tissue plasminogen activator activity in vitro in rat model. Biofarmaceptical Journal, 2020, vol. 12, pp. 38-42.
7. IUPAC-IUB, Quantity, Units and Symbols in Physical Chemistry. Oxford: Blackwell Scientific Publications, 1988, vol. 39.
8. Максумов И.С., Исмаилова Л.И., Годжаев Н.М. Программа полуэмпирического расчета конформаций молекулярных комплексов на ЭВМ. Журнал структурной химии, 1983, т. 24, № 4, с. 147-148.
9. Akhmedov N.A., Gadjieva Sh.N., Abbasli R.M. Structural organization of Asp-Pro- Lys-Gln-Asp-Phe-Met-Arg-Phe-NH2 molecule. Current Topics in Peptide Protein Research, 2009, vol. 10, pp. 57-62.
10. Akhmedov N.A., Ismailova L.I., Agayeva L.N., Godjaev N.M. The spatial structure of the cardio active peptides. Current Topics in Peptide Protein Research, 2010, vol. 11, pp. 87-93.
11. Akhmedov N.A., Ismailova L.I., Abbasli R.M., Agayeva L.N., Akhmedova S.R. Spatial structure of Octarphin Molecule. IOSR Journal of Applied Physics, 2016, vol. 8, pp. 66-70.
12. Akhmedov N.А., Agayeva L.N., Akhmedova S.R., Abbasli R.M., Ismailova L.I. Spatial structure of the β- Casomorphin-7 Molecule. Journal of Applied Physics (IOSR-JAP), 2021, vol. 13, pp. 62-67.
13. Ismailova L.I., Abbasli R.M., Akhmedov N. Computer Modeling of the Spatial Structure of Nonapeptide Molecule. COIA, 2020, vol. 1, pp. 218-221.
14. Исмаилова Л.И., Aббаслы Р.М., Ахмедов Н.А. Структурная организация молекулы Gly-Pro-Arg-Pro. Актуальные вопросы биологической физики и химии, 2021, т. 6, № 1, с. 53-56.
