Баку, Азербайджан
Баку, Азербайджан
Баку, Азербайджан
Методом теоретического конформационного анализа исследованы конформационные возможности молекул сойморфина-5 (Thr1-Pro2-Phe3-Val4-Val5-NH2), сойморфина-6 (Tyr1-Pro2-Phe3-Val4-Val5-Asn6-NH2) и сойморфина-7 (Tyr1-Pro2-Tyr3-Val4-Val5-Asn6-Ala7-NH2). Потенциальная функция системы выбрана в виде суммы невалентных, электростатических и торсионных взаимодействий и энергии водородных связей. Найдены низкоэнергетические конформации молекул сойморфина-5, сойморфина-6 и сойморфина-7, значения двугранных углов основных и боковых цепей аминокислотных остатков, входящих в состав молекул, оценена энергия внутри- и межостаточных взаимодействий. Показано, что пространственная структура молекул сойморфина-5, сойморфина-6 и сойморфина-7 представлена конформациями восьми шейпов пептидного скелета. Таким образом, пространную структуру молекул сойморфина-5, сойморфина-6 и сойморфина-7 можно представить восемью структурными типами. Можно предположить, что молекулы свои физиологические функции осуществляет в этих структурах. Сравнение низкоэнергетических структур сойморфинов показывают, что во всех молекулах первые четыре низкоэнергетические конформации являются представителями структурных типов efef, efee, efff, effe у сойморфина-5, effff, efeff, efffe, effee у сойморфина-6, efffff, efeffe, efffef, effeee у сойморфина-7. На основе этих структур можно предложить их искусственных аналогов для синтеза. Полученные результаты могут быть использованы для выяснения структурной и структурно-функциональной организации молекул сойморфинов.
экзорфин, сойморфин, опиоид, структура, конформация
1. Чеснокова Е.А., Сарычева Н.Ю., Дубынин В.А., Каменский А.А. Опиоидные пептиды, получаемые с пищей и их влияние на нервную систему. Успехи физиологических наук, 2015, т. 46, № 1, с. 22-46.; EDN: https://elibrary.ru/TOESOP
2. Соколов О.Ю., Кост Н. В., Андреева О.О., Корнеева Е.В., Мешавкин В.К., Тараканова Ю.Н., Дадаян А.К., Золотарев Ю.А., Грачев С.А., Михеева И.Г., Зозуля А.А. Возможная роль казоморфинов в патогенезе аутизма. Психиатрия, 2010, т. 45, № 3, с. 29-35.; EDN: https://elibrary.ru/MVCWAR
3. Sienkiewiez-Szlapka E., Jarmolowska B., Krawczuk S., Kostyara E. Contents of agonistic and antagonistic opioid peptides in different cheese varieties. Int. Dairy J., 2009, vol. 19, no. 4, pp. 258-263.
4. Ахмедов Н.А. Теоретический конформационный анализ молекул β-казоморфина, валмуцептина и морфицептина. Молекулярная Биология, 1989, т. 23, с. 240-248.
5. Ахмедов Н.А., Годжаев Н.М., Сулейманова Е.В., Попов Е.М. Структурная организация молекул [Met] энкефалина и эндорфинов. Биоорганическая химия, 1990, т. 16, с. 649-667.
6. Гаджиева Ш.Н., Ахмедов Н.А., Масимов Э.А., Годжаев Н.М. Пространственная структура молекулы Thr-Pro-Ala-Glu-Asp-Phe-Met-Arg-Phe-NH2. Биофизика, 2013, т.58, вып. 4, с. 587-590.; EDN: https://elibrary.ru/QZDKIR
7. Akhmedov N.A., Ismailova L.I., Abbasli R.M. et al. Spatial Structure of Octarphin molecule. IOSR J. Applied Physics (IOSR-JAP), 2016, vol. 8, pp.66-70.
8. Ismailova L.I., Abbasli R.M., Akhmedov N. Computer Modeling of the Spatial Structure of Nonapeptide Molecule. COIA 2020, Baku, Azerbaijan, vol. I, pp. 218-221.
9. Akhmedov N.A., Agayeva L.N., Akverdieva G.A., Abbasli R.M., Ismailova L.I. Spatial structure of the ACTH-(6-9)-PGP molecule. J. Chem. Soc. Pak., 2021, vol. 43, no. 05, pp. 500-504.
10. Akhmedov N.A., Agayeva L.N., Akhmedova S.R., Abbasli R.M., Ismailova L.I. Spatial structure of the β-Casomorphin-7 Molecule. IOSR Journal of Applied Physics (IOSR-JAP), 2021, vol.13, iss. 5, ser. II, pp. 62-67, doi:https://doi.org/10.9790/4861-1305026267.
11. Agayeva L.N., Abdinova A.A., Akhmedova S.R., Akhmedov N.A. Spatial Structure of the ACTH-(7-10) Molecule. Biophysics, 2021, vol. 66, no. 4, pp. 531-534.
12. Akhmedov N.A., Abbasli R.M., Agayeva L.N., Ismailova L.I. Three-dimensional structure of exorpin B5 molecule. Conference proceedings Modern Trends in Physics, 2019, pp. 201-104.; EDN: https://elibrary.ru/KHVFIG
13. IUPAC-IUB. Quantities, Units and Symbols in Physical Chemistry, Blackwell Scientific, Oxford 1993.
