Настоящая работа направлена на развитие теоретической модели, посвященной иерархическому структурообразованию в биомакромолекулах. Ранее в макромолекулярных системах были выделены знакопеременные уровни иерархии хиральных объектов в последовательности от «нижнего» ассиметричного атома углерода до суперспиралей и надмолекулярных структур - прослеживается закономерное чередование знака хиральности D-L-D-L при переходе на более высокий уровень структурно-функциональной организации ДНК, так же как и смена знака хиральности L-D-L-D в белковых структурах. Авторами составлен алгоритм поиска и расчета математических параметров спиральных структур известных белковых молекул по координатам их атомов и проведена оптимизация обработки случаев с неочевидной спирализацией для последующего накопления базы данных разрешенных конформаций суперспиралей. Данная информация может быть использована для систематизации белковых суперструктур по параметрам и для анализа соответствия разрешенных зон с их функциональной нагрузкой.
хиральная иерархия, молекулярные машины, белковая самоорганизация
1. Шмутцер Э. Симметрии и законы сохранения в физике. М.: Мир, 1974, 159 c. [Schmutzer E. Symmetries and conservation laws in physics. М.: Mir, 1974, 159 p. (In Russ.)]
2. Урманцев Ю.А. Симметрия природы и природа симметрии. М.: Комкнига. 2007, 232 c. [Urmantsev Yu.A. Symmetry of nature and the nature of symmetry. М.: Komkniga, 2007, 232 p. (In Russ.)]
3. Заренков Н.А. Биосимметрика. М.: Книжный дом «ЛИБРОКОМ», 2009, 320 c. [Zarenkov N.A. Biosymmetric. М.: Knizhny dom «LIBROKOM», 2009, 320 p. (In Russ.)]
4. Белоусов Л.В. Симметриийные преобразования в развитии организмов. Морфогенез в индивидуальном и историческом развитии: симметрия и асимметрия. Серия «Геобиологические системы в прошлом». М.: ПИН РАН, 2013, с. 6-21. [Вelousov L.V. Symmetry transformations in the development of organisms. Morphogenesis in individual and historical development: symmetry and asymmetry. Part «Geobiological systems in the past». М.: PIN Russian Academy of Sciences, 2013, pp. 6-21. (In Russ.)]
5. Твердислов В.А., Сидорова А.Э., Яковенко Л.В. Биофизическая экология. М.: URSS, КРАСАНД, 2012, 544 c. [Tverdislov V.A., Sidorova A.E., Yakovenko L.V. Biophysical ecology. М.: URSS, KRASAND, 2012, 544 p. (In Russ.)]
6. Georges H. Wagnière. On Chiralty and the Universal Asymmetry. © Verlag Helvetica Chimica Acta, Zürich, 2007, 247 p.
