Методом теоретического конформационного анализа исследована пространственная структура молекулы ACTH-(5-7)-PGP. Аминокислотная последовательность N-концевого трипептидного участка молекулы Glu- His-Phe-Pro-Gly-Pro соответствует фрагменту 5-7 адренокортикотропного гормона. Расчет молекулы выполнен с помощью метода теоретического конформационного анализа. Потенциальная функция системы выбрана в виде суммы невалентных, электростатических и торсионных взаимодействий и энергии водородных связей. Пространственная структура молекулы Glu-His-Phe-Pro-Gly-Pro рассчитана на основе низкоэнергетических конформаций соответствующих аминокислотных остатков. Показано, что пространственная структура гексапептидной молекулы может быть представлена восемью низкоэнергетическими формами основной цепи. Найдены низкоэнергетические конформации молекулы, значения двугранных углов основных и боковых цепей аминокислотных остатков, оценена энергия внутри- и межостаточных взаимодействий.
АСТН-(5-7), теоретический конформационный анализ, пространственная структура, конформация, АСТН
1. Шевченко K.В., Дулов С.А., Андреева Л.А., Нагаев И.Ю., Шевченко В.П., Радилов А.С., Мясоедов Н.Ф. Устойчивость His-Phe-Arg-Trp-Pro-Gly-Pro к действию лейцинаминопептидазы, карбоксипептидазы Y и ферментным системам назальной слизи, крови и плазмы крови крыс. Биоорганическая химия, 2016, т. 42, № 2, с. 171-181.
2. IUPAC-IUB, Quantiby, Units and Sybbols in Physical Chemistry. Blackwell Scientific Publications, 1998, vol. 39.
3. Akhmedov N.A., Tagiyev Z.H., Hasanov E.M., Akverdieva G.A.Theoretical conformational analisis of the bovine adrenal medulla 12 residue peptide molecule. J.Molecular Structure, 2003, vol. 646, pp. 75-80.
4. Akhmedov N.A., Ismailova L.I., Agayeva L.N., Gocayev N.M. The spatial structure of the cardio active peptides. Peptid and Protein Research, 2010, vol. 11, pp. 87-93.
5. Гаджиева Ш.Н., Ахмедов Н.А., Масимов Э.А, Годжаев Н.М. Пространственная структура молекулы Thr-Pro- Ala-Glu-Asp-Phe-Met-Arg-Phe-NH2. Биофизика, 2013, т. 58, вып. 4, c. 587-590. [Gadjieva Sh.N., Akhmedov N.A., Masimov E.A., Godjaev N.M. Spatial Structure of Thr-Pro-Ala-Glu-Asp-Phe-Met-Arg-Phe-NH2. Biophysics, 2013, vol. 58, pp. 587-590 (In Russ.)]
