ЭКОЛОГИЧЕСКАЯ БИОФИЗИКА: ОПЫТ МАТЕМАТИЧЕСКОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ ДИНАМИКИ ТРАНСГЕННЫХ МИКРОБНЫХ ПОПУЛЯЦИЙ
Аннотация и ключевые слова
Аннотация (русский):
Настоящая статья посвящена математическому моделированию динамики популяций трансгенных микроорганизмов (ГМО) при культивировании в хемостате. Причины нестабильности трансгенных микроорганизмов при длительном периодическом или непрерывном культивировании в хемостате не совсем понятны до сих пор. Почему клетки, содержащие плазмиды с клонированными генами, растут медленнее бесплазмидных также неясно: или это прямое влияние экспрессии плазмидных генов на жизнеспособность плазмидсодержащих клеток, ингибирование клеточного роста или же расходование клеточных ресурсов на поддержание плазмид. Оценка параметров нестабильности плазмид с помощью методов, предложенных в настоящей работе, является первым шагом к пониманию главной причины: почему трансгенные микроорганизмы теряют плазмиды при культивировании и не теряют их в природе (плазмидный парадокс).

Ключевые слова:
трансгенные микроорганизмы, нестабильность плазмид, математическое моделирование, стоимость плазмид, непрерывное культивирование микроорганизмов, хемостат
Текст
Текст произведения (PDF): Читать Скачать
Список литературы

1. Kumar N.M., Muthukumaran C., Sharmila G., Gurunathan B. Genetically Modified Organisms and Its Impact on the Enhancement of Bioremediation. Bioremediation: Applications for Environmental Protection and Management. Energy, Environment, and Sustainability, 2018, pp. 53-76.

2. de Santisa B., Stockhofeb N., Walc J.-M. [et al.] Case studies on genetically modified organisms (GMOs): Potential risk scenarios and associated health indicators. Food and Chem. Toxicology, 2018, vol. 117, pp. 36-65.

3. Brilkov A.V., Ganusov V.V., Morozova E.V. and Pechurkin N.S. Computer modeling of the biotic cycle formation in a closed ecological system. Adv. Space Res., 2001, vol. 27, no. 9, pp. 1587-1592.

4. Levin B.R., Stewart F.M. The population biology of bacterial plasmids: A priori conditions for the existence of conjugationally transmitted factors. Genetics, 1977, vol. 87, no. 10, pp. 209-228.

5. Ризниченко Г.Ю. Лекции по математическим моделям в биологии. М.: Ижевск: Изд-во НИЦ «Регулярная и хаотическая динамика», 2011, 560 с. @@[Riznichenko G.Yu. Lections on mathematical models in biology. M.: Izhevsk: RCD Publishing, 2011, 560 p. (In Russ.)]

6. Gitelzon I.I., Pechurkin N.S., Brilkov A.V. Population Problems in the Biology of Unicellular Organisms. London: Harwood Academic Publ. GmbH, United Kingdom, 1989, 77 p.

7. San Millan A.,. Pen˜a-Miller R, Toll-Riera1 M., Halbert Z.V., McLean A.R., Cooper B.S., MacLean R.C. Positive selection and compensatory adaptation interact to stabilize non-transmissible plasmids. Nature Communications, 2014, vol. 5, article number: 5208.

8. Moser H. The dynamics of bacterial populations maintained in the chemostat. Carnegie Institution of Washington, 1958.

9. Ganusov V.V., Brilkov A.V. Estimating the instability parameters of plasmid-bearing cells. I. Chemostat culture. J. of Theor. Biol., 2002, vol. 219, no. 2, pp. 193-205.

10. Wouters J.T.M., Driehuis F.L., Polaczek P.J. [et al.] Persistence of the pBR322 plasmid in Escherichia coli K12 grown in chemostat cultures. Antonie van Leewenhoek, 1980, vol. 46, no. 4, pp. 353-362.

11. Fedorec A.J.H., Ozdemir T., Doshi A. [et al.] Two New Plasmid Post-segregational Killing Mechanisms for the Implementation of Synthetic Gene Networks in Escherichia coli. Science, 2019, vol. 14, pp. 323-324.

12. MacLean R.C., Alvaro S.M. Microbial Evolution: Towards Resolving the Plasmid Paradox. Current Biology., 2015, vol. 25, no. 17, pp. R753-R773.


Войти или Создать
* Забыли пароль?